More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0247 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  640    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.23 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  33.69 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  32.38 
 
 
310 aa  160  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 
361 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
320 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  30.79 
 
 
312 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  31.64 
 
 
310 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  29.71 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.24 
 
 
361 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
319 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  33.47 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 
355 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  28.35 
 
 
335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
327 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  28.12 
 
 
340 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.25 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  27.3 
 
 
340 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1214  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  28.48 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0717  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
343 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 
353 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  27.66 
 
 
328 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  30.55 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.81 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0723  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.38 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  27.58 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  27.39 
 
 
335 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  27.66 
 
 
335 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
315 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  27.55 
 
 
346 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  28.12 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
323 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  27.94 
 
 
346 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
517 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
335 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  28.85 
 
 
517 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  28.66 
 
 
319 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  26.2 
 
 
334 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  27.07 
 
 
340 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
328 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 
320 aa  122  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  27.66 
 
 
332 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  25.56 
 
 
334 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  25.82 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  25.88 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 
345 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
314 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  25.83 
 
 
332 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
344 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.56 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
331 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 
327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  27.34 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 
342 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
341 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
341 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  31.39 
 
 
350 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.05 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  27.33 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.53 
 
 
310 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  26.25 
 
 
334 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  28.05 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
337 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  26.75 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  24.09 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.91 
 
 
352 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
322 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
345 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
345 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.09 
 
 
288 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.76 
 
 
288 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 
337 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 
345 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 
341 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.76 
 
 
288 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
363 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>