249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0015 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
126 aa  244  4e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
126 aa  74.7  4e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 
124 aa  70.9  6e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  41.75 
 
 
122 aa  70.5  7e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
134 aa  69.3  2e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
122 aa  69.3  2e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  43.27 
 
 
122 aa  68.2  4e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  34.13 
 
 
126 aa  67.4  6e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 
127 aa  67.4  6e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  5.84991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
124 aa  66.6  1e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
124 aa  66.6  1e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
122 aa  65.5  2e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.66 
 
 
125 aa  64.3  5e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
126 aa  64.3  6e-10  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
125 aa  63.5  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
125 aa  62  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
123 aa  62  3e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.4 
 
 
124 aa  61.2  4e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  35 
 
 
125 aa  61.2  5e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.27 
 
 
127 aa  59.7  1e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 
129 aa  59.3  2e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
127 aa  58.2  4e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  36.26 
 
 
127 aa  57.8  6e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.29 
 
 
127 aa  57.4  7e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.98 
 
 
126 aa  57  8e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  38.55 
 
 
105 aa  56.6  1e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  34.95 
 
 
127 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.98 
 
 
126 aa  56.6  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  33.7 
 
 
109 aa  56.2  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  38.67 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 
124 aa  55.8  2e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  38.67 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.5  3e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2393  Camphor resistance CrcB protein  37.5 
 
 
133 aa  55.5  3e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  34.91 
 
 
127 aa  55.1  3e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.5  3e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  34.95 
 
 
127 aa  55.5  3e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.5  3e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.5  3e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  34.95 
 
 
127 aa  55.5  3e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.62452e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
126 aa  54.7  5e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.33 
 
 
127 aa  54.3  5e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  33.33 
 
 
131 aa  53.9  8e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 
154 aa  53.5  9e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  31.13 
 
 
132 aa  53.5  1e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  44.78 
 
 
123 aa  53.1  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  30.11 
 
 
133 aa  53.1  1e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
124 aa  52.4  2e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.98 
 
 
143 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  31.96 
 
 
126 aa  52.4  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  8.76303e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
124 aa  52.4  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.53648e-07  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 
127 aa  52.8  2e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  33.04 
 
 
124 aa  52.4  2e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  33.93 
 
 
142 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37 
 
 
134 aa  52.8  2e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  29.31 
 
 
124 aa  52.4  2e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37 
 
 
134 aa  52.8  2e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 
99 aa  52.8  2e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  32.05 
 
 
120 aa  52.4  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 
124 aa  52.8  2e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  30.1 
 
 
127 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  30.1 
 
 
127 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.26 
 
 
118 aa  52  3e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.69e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  33.64 
 
 
117 aa  52  3e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  30.1 
 
 
127 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  30.1 
 
 
127 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  30.1 
 
 
127 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  33.96 
 
 
139 aa  51.6  4e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  35.23 
 
 
124 aa  51.6  4e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  29.73 
 
 
131 aa  51.2  4e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  33.94 
 
 
136 aa  51.2  5e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  32.18 
 
 
151 aa  51.2  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  33.33 
 
 
118 aa  50.8  6e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  29.31 
 
 
124 aa  50.8  6e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  29.31 
 
 
124 aa  50.8  6e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  29.31 
 
 
124 aa  50.8  6e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  3.69188e-05  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 
129 aa  50.4  8e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
124 aa  50.4  8e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.81037e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34.04 
 
 
270 aa  50.4  8e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 
124 aa  50.4  8e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.83526e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  31.65 
 
 
127 aa  50.4  9e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.88116e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  29.66 
 
 
124 aa  50.1  9e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1210  camphor resistance protein CrcB  33.66 
 
 
114 aa  50.4  9e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  28.7 
 
 
134 aa  50.4  9e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.68029e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  31.65 
 
 
127 aa  50.1  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.63248e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
132 aa  50.1  1e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  27.56 
 
 
131 aa  49.7  1e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  31.82 
 
 
149 aa  49.7  1e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 
131 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  30.33 
 
 
130 aa  49.7  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  36.54 
 
 
117 aa  49.7  1e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  32.26 
 
 
127 aa  50.1  1e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  34.04 
 
 
138 aa  48.9  2e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  31.4 
 
 
128 aa  49.3  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  34.02 
 
 
147 aa  49.3  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  34.02 
 
 
147 aa  49.3  2e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  30.77 
 
 
162 aa  48.9  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  30.17 
 
 
124 aa  49.3  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  7.01119e-05  hitchhiker  2.63281e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>