More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3729 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  81.08 
 
 		 260 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  72.76 
 
 		 260 aa  360  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  67.31 
 
 		 260 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  68.08 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  67.06 
 
 		 259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  62.4 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  55.04 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  45.45 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  49.8 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  50.2 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  49.19 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  48.94 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  46.25 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  44.88 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  39.06 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  40.86 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.83 
 
 		 405 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 536 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 490 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  46.41 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  41.88 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  45.73 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  48.28 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  39.22 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  44.71 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.49 
 
 		 424 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  39.24 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  42.63 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.62 
 
 		 424 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.86 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.76 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  48.43 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.61 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.07 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  41.8 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  41.39 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1432  ABC transporter related  34.27 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.42 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  39.5 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  42.92 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  41 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  47.64 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  43.88 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  38.66 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  38.66 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.66 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.24 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  36.91 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  39.41 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  42.37 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  39.33 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  40.33 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.85 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  42.48 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  32.94 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.37 
 
 		 625 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  47.83 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  40.33 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  35.86 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  35.86 
 
 		 269 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.82 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  47.03 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.8 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  35.78 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  40.85 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  40.68 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.05 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.66 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  41.18 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3693  ABC transporter related  41.33 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.66 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  35.86 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  35.54 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  43.88 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  36.71 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  36.82 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.79 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  42.11 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  35.92 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  37.5 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.29 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>