More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4320 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
220 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  78.64 
 
 
231 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  67.44 
 
 
217 aa  295  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  61.29 
 
 
219 aa  272  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  56.87 
 
 
217 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  51.42 
 
 
214 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  52.36 
 
 
215 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  49.3 
 
 
221 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  51.63 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  50.94 
 
 
219 aa  202  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  48.57 
 
 
213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 
238 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.52 
 
 
220 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
222 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
222 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
222 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  44.55 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  44.55 
 
 
220 aa  181  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  48.1 
 
 
222 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  44.29 
 
 
221 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 
220 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 
220 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  45.02 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  45.28 
 
 
225 aa  165  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  46.48 
 
 
214 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 
224 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 
214 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 
222 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 
219 aa  158  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 
223 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
220 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  38.68 
 
 
230 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 
220 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  35.87 
 
 
232 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.28 
 
 
226 aa  148  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  37.44 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  36.7 
 
 
224 aa  138  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.49 
 
 
226 aa  135  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.68 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  37.74 
 
 
234 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 
218 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 
228 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 
220 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  31.46 
 
 
218 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 
216 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.46 
 
 
228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.46 
 
 
218 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.46 
 
 
218 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.18 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.99 
 
 
218 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.92 
 
 
218 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  30.99 
 
 
218 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 
230 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  30.99 
 
 
218 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.92 
 
 
218 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
220 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 
226 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 
222 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 
219 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
233 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 
233 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 
219 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  33.63 
 
 
237 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  30.13 
 
 
233 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  31.51 
 
 
236 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
233 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  29.68 
 
 
238 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  30.28 
 
 
218 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
233 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 
226 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
223 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 
219 aa  101  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
228 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 
219 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 
219 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  32.43 
 
 
237 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 
243 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  31.78 
 
 
227 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
237 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  28.7 
 
 
217 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 
237 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
239 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 
237 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
236 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  27.01 
 
 
214 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.95 
 
 
237 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  29.22 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.7 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  34.84 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
222 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 
242 aa  98.6  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 
217 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>