More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0061 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0061  ribosomal protein S18  100 
 
 		 73 aa  149  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.854939  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  41.38 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0782  30S ribosomal protein S18  52.73 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.04238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00021  30S ribosomal protein S18  41.38 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002334  SSU ribosomal protein S18p  41.38 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0221  ribosomal protein S18  42.11 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  41.38 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  43.64 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2764  30S ribosomal protein S18  40.35 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0829  ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  42.11 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1479  ribosomal protein S18  51.85 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  45.61 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  44.64 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  36.84 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  36.84 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  38.6 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0694  30S ribosomal protein S18  45.28 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.276766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0309  30S ribosomal protein S18  45.28 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  36.84 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  38.98 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0310  ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0899357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1382  ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  38.98 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3353  ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0417  ribosomal protein S18  37.5 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0682  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1776  30S ribosomal protein S18  40.38 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3782  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3637  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  44.44 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0448  30S ribosomal protein S18  39.29 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  50 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  44.64 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  39.66 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0164  30S ribosomal protein S18  42.86 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000186991  normal  0.608438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  36.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  44.64 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  37.93 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37790  SSU ribosomal protein S18P  41.07 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.122065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4337  30S ribosomal protein S18  41.07 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  43.86 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  34.48 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26570  30S ribosomal protein S18  41.07 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.265078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  36.84 
 
 		 76 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0167  ribosomal protein S18  46.3 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000272348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  34.48 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3698  ribosomal protein S18  41.07 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  43.4 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  42.59 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  37.5 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  34.48 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  36.84 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3729  30S ribosomal protein S18  37.5 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  46.15 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  42.37 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2132  30S ribosomal protein S18  38.6 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157171  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  42.59 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  44 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  43.64 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2051  30S ribosomal protein S18  38.6 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.255921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  35.71 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>