More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0309 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0309  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 95 aa  191  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0694  30S ribosomal protein S18  97.89 
 
 		 95 aa  160  7e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.276766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0782  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.04238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  57.75 
 
 		 95 aa  87  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  54.93 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2295  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0262135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  52.11 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1901  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  49.33 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  52.11 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  53.97 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4636  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2591  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  47.14 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3814  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.295923  normal  0.120309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1309  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  46.05 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1781  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.708911  normal  0.881884 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1809  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_002620  TC0185  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  46.05 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3214  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2393  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1184  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0394823  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2454  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427357  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  49.21 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>