More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0782 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0782  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.04238  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0694  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.276766  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0309  30S ribosomal protein S18  64.29 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  56.16 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1044  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2187  30S ribosomal protein S18  55.07 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  51.39 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  56.72 
 
 
78 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  43.33 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0084  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 
74 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.448199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  45.95 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0568  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
82 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5420  30S ribosomal protein S18  52.31 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0173473  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3362  ribosomal protein S18  54.84 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0454  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0234797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1415  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  43.48 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  48.57 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1917  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0460  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  49.25 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  54.55 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1086  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000857615  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0928  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0375041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2463  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 
71 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1519  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  52.31 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  50.75 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0413  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  51.47 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0740  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 
82 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.182149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0913  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.317596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1196  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.215666  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  51.56 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2295  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0262135  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  47.22 
 
 
75 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4416  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1053  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3941  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.182221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4309  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0685461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2591  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 
83 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1549  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1434  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  47.76 
 
 
74 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4636  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1820  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179313  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  47.06 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  52.31 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  46.27 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  49.25 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0899  30S ribosomal protein S18  53.23 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0242171 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  48.44 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1901  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  49.3 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  49.3 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  48.19 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2304  30S ribosomal protein S18  50.77 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.554922  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2393  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2004  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5729  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.237828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1977  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.402888  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0449  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
73 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000993889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1123  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
71 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.561974  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  46.48 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  49.23 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1621  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0249871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3035  30S ribosomal protein S18  46.38 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>