More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_21431 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  99.34 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  80.92 
 
 
152 aa  250  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  77.63 
 
 
152 aa  246  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 
152 aa  243  8e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  77.63 
 
 
152 aa  242  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  70.2 
 
 
151 aa  220  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  71.9 
 
 
151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  68.87 
 
 
151 aa  216  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  70.59 
 
 
151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  60.93 
 
 
152 aa  191  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
152 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 
152 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  51.97 
 
 
152 aa  157  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  49.01 
 
 
152 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  46.36 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  46.36 
 
 
152 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
146 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  39.19 
 
 
195 aa  100  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.28 
 
 
147 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
150 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  35.95 
 
 
148 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  41.45 
 
 
150 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.16 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.01 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  38.96 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  37.67 
 
 
178 aa  92  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
168 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  38.67 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
147 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  38.26 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  31.76 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
191 aa  90.1  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  33.56 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  35.66 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
147 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  33.77 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
149 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  32.64 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
171 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1401  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2413  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.209378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1165  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2288  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0005  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1892  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 
150 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  32.43 
 
 
148 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  36.42 
 
 
148 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2182  50S ribosomal protein L9  38.97 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  35.62 
 
 
181 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  34.69 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  35.98 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  32.89 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  36.67 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  34.67 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.18 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  34.9 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 
148 aa  84.7  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  33.77 
 
 
152 aa  84  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
149 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 
149 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  36 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>