68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2967 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  789    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  54.73 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  49.07 
 
 
411 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
469 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  40.72 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  36.3 
 
 
768 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  39.29 
 
 
410 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  40.08 
 
 
783 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  44.16 
 
 
432 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  30.6 
 
 
307 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  30.6 
 
 
307 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  30.6 
 
 
307 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  31.84 
 
 
528 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  31.3 
 
 
540 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  35.11 
 
 
655 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  28.17 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  30.04 
 
 
413 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  30.04 
 
 
433 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  30.04 
 
 
433 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  34.17 
 
 
401 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  33.51 
 
 
898 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  26.95 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  31.98 
 
 
580 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  27.08 
 
 
517 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  31.58 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  31.58 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  31.58 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  34.17 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  26.67 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  30.06 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  31.25 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  28.08 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  33.33 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  28.43 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  27.25 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  27.25 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  31.15 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  26.96 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  28.33 
 
 
502 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  28.34 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  40.4 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  40.4 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  26.01 
 
 
448 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  27.55 
 
 
533 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  29.74 
 
 
526 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  26.11 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  26.11 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  26.11 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  31.22 
 
 
359 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  30.99 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5244  hypothetical protein  29.7 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  28.11 
 
 
380 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  29.74 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  29.38 
 
 
458 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  30.84 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  27.95 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  27.94 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  33.33 
 
 
527 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4398  hypothetical protein  24.78 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4692  hypothetical protein  24.78 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4312  hypothetical protein  24.78 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.400597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0967  hypothetical protein  32.54 
 
 
529 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0508627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0949  PE-PPE-like protein  32.54 
 
 
529 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  51.22 
 
 
479 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  24.61 
 
 
461 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>