206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0743 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  100 
 
 
165 aa  335  2e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  66.46 
 
 
168 aa  223  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  67.52 
 
 
168 aa  221  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  60.49 
 
 
168 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  61.11 
 
 
168 aa  211  3e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  58.68 
 
 
163 aa  205  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  57.76 
 
 
164 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  60.9 
 
 
164 aa  188  3e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  57.83 
 
 
165 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  55.42 
 
 
166 aa  182  2e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  55.42 
 
 
166 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  57.23 
 
 
166 aa  181  4e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  56.02 
 
 
165 aa  181  4e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  56.02 
 
 
165 aa  180  9e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  54.82 
 
 
166 aa  180  9e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  60.78 
 
 
166 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  53.01 
 
 
166 aa  178  3e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  60.13 
 
 
166 aa  177  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  62.2 
 
 
169 aa  177  5e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  57.14 
 
 
165 aa  177  5e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  55.49 
 
 
166 aa  177  5e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  55.76 
 
 
164 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  53.89 
 
 
166 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  54.88 
 
 
166 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  51.81 
 
 
166 aa  174  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  53.66 
 
 
164 aa  171  4e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  52.76 
 
 
172 aa  167  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  58.02 
 
 
163 aa  166  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  164  3e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  49.4 
 
 
165 aa  164  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.55 
 
 
164 aa  163  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  48.47 
 
 
166 aa  162  1e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  53.42 
 
 
167 aa  162  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  50.6 
 
 
166 aa  162  2e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  50.6 
 
 
165 aa  161  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  51.81 
 
 
166 aa  160  8e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  50.92 
 
 
166 aa  157  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  49.4 
 
 
166 aa  157  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  48.8 
 
 
166 aa  156  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  51.2 
 
 
166 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  49.42 
 
 
185 aa  155  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  47.24 
 
 
167 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  50.61 
 
 
168 aa  154  5e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  50.32 
 
 
158 aa  153  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  48.47 
 
 
170 aa  150  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  47.5 
 
 
167 aa  148  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  47.85 
 
 
170 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  46.63 
 
 
173 aa  145  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  47.85 
 
 
170 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.68 
 
 
184 aa  144  8e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  49.07 
 
 
167 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  44.71 
 
 
184 aa  139  1e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  44 
 
 
185 aa  139  2e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  43.64 
 
 
168 aa  137  5e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  45.68 
 
 
169 aa  135  3e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.76 
 
 
184 aa  135  3e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  44.38 
 
 
169 aa  134  6e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  43.1 
 
 
182 aa  132  2e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  46.71 
 
 
178 aa  126  1e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  46.71 
 
 
178 aa  126  2e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  53.03 
 
 
140 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  44.2 
 
 
182 aa  124  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  52.24 
 
 
139 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  40.12 
 
 
184 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  53.03 
 
 
140 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  41.38 
 
 
182 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  53.03 
 
 
168 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  44.03 
 
 
233 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  52.27 
 
 
139 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.45358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  37.36 
 
 
228 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  53.03 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  53.03 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  53.03 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  52.27 
 
 
140 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  120  1e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  40 
 
 
182 aa  120  1e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  52.27 
 
 
139 aa  120  1e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  6.55626e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  51.52 
 
 
139 aa  120  1e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  117  8e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  51.52 
 
 
140 aa  116  1e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  37.58 
 
 
166 aa  116  1e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  50 
 
 
139 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50 
 
 
139 aa  114  4e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  42.17 
 
 
167 aa  112  2e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  48.48 
 
 
140 aa  112  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.31 
 
 
179 aa  111  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  48.48 
 
 
139 aa  110  7e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  48.48 
 
 
139 aa  110  8e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  48.48 
 
 
139 aa  110  8e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  42.14 
 
 
179 aa  109  1e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>