More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3730 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  66.54 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  67.33 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  67.33 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  71.73 
 
 		 238 aa  274  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  71.81 
 
 		 201 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  58 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  57.06 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  48.15 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  48.39 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  47.37 
 
 		 224 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  47.71 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  47.71 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  57.06 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  57.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  51.81 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  57.87 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  51.81 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  46.61 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  55.56 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  47.72 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  56.28 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  53.26 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  56.18 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  51.41 
 
 		 207 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  47.54 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  45.05 
 
 		 204 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  43.41 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.61 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  43.48 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  49.2 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  42.93 
 
 		 196 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  44.19 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  40.21 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  42.13 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  46.3 
 
 		 186 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  44.24 
 
 		 178 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  44.15 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  46.96 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.56 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  40.67 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  42.74 
 
 		 152 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  45.61 
 
 		 151 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  42.74 
 
 		 152 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.36 
 
 		 161 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  38.67 
 
 		 152 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  42.98 
 
 		 153 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  40.69 
 
 		 151 aa  96.3  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  36.8 
 
 		 154 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  36.72 
 
 		 150 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  36.72 
 
 		 150 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  36.72 
 
 		 150 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  36.72 
 
 		 154 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  39.33 
 
 		 152 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  36.72 
 
 		 150 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  36.72 
 
 		 150 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  36.72 
 
 		 150 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  36.72 
 
 		 154 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  39.02 
 
 		 140 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  37.33 
 
 		 152 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  37.33 
 
 		 152 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.73 
 
 		 169 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.73 
 
 		 169 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 		 140 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  49.51 
 
 		 176 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  34.38 
 
 		 150 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  41.82 
 
 		 169 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  41.82 
 
 		 152 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  36.59 
 
 		 140 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.59 
 
 		 153 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  33.59 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  40.32 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  43.64 
 
 		 166 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>