More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2686 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  83.33 
 
 		 166 aa  288  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  82.1 
 
 		 164 aa  278  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  82.1 
 
 		 164 aa  278  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  82.14 
 
 		 166 aa  263  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  82.14 
 
 		 166 aa  263  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  64.23 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  61.76 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  61.76 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  60.14 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  63.43 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  63.43 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  61.94 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  61.31 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  66.13 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  66.13 
 
 		 139 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  61.11 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  63.36 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  63.36 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  60.16 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  61.83 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  58.39 
 
 		 143 aa  165  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  55.64 
 
 		 147 aa  160  8.000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  57.46 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  54.74 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 137 aa  154  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  53.44 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  55.15 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  51.41 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  54.62 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  52.67 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  49.21 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  48.44 
 
 		 146 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  48.44 
 
 		 146 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  49.21 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  48 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  50.81 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  47.58 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  46.96 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 136 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  38.71 
 
 		 131 aa  84.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  38.71 
 
 		 141 aa  84.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  35.66 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  39.34 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  30.66 
 
 		 136 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  39.39 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  33.86 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  28.35 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  44.58 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  44.58 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  38.24 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  39 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  34.26 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  39 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.75 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  38.27 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  39 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  37 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  33.01 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  33.65 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  32.41 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  35.24 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  36.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  39 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  33.33 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  32.35 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  38.54 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  33.65 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  30.36 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  35.05 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  33.03 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  39 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  34.06 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  36.36 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  38 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  31.73 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>