136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4659 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 419 aa  807    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  82.58 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  69.25 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  72.12 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  68.75 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  67.96 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  68.2 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  66.27 
 
 		 419 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  64.51 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  63.07 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  68.77 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  69.93 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  66.75 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  66.1 
 
 		 443 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  63.19 
 
 		 440 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  62.73 
 
 		 440 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  60.42 
 
 		 440 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  62.59 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  62.35 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  62.11 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  62.35 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  61.63 
 
 		 426 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  66.03 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  61.48 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  61.77 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  60.09 
 
 		 438 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  61 
 
 		 421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  63.93 
 
 		 448 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  65.47 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  63.07 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  66.11 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  63.33 
 
 		 447 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  59.45 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  61.26 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  63.31 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  59.63 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  61.39 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  53.07 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  59.71 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  55.26 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  53.57 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  58.47 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  61.48 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  52.83 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  56.76 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  67.63 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  54.18 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  53.55 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  55.21 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  57.41 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  54.42 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  54.61 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  54.78 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  53.25 
 
 		 407 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  56.94 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  57.38 
 
 		 422 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  52.15 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  58.03 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  55.32 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  53.43 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  57.61 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  54.46 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  47.78 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  52.53 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0771  hydroxypyruvate reductase  82.65 
 
 		 235 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  48.77 
 
 		 451 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  47.9 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  47.47 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  51.57 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  51.54 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  51.47 
 
 		 374 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  47.88 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  47.88 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  50 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  48.11 
 
 		 439 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2031  hydroxypyruvate reductase  48.24 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560327 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  47.22 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  46.17 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  50.47 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  48.82 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7083  putative hydroxypyruvate reductase  48.25 
 
 		 426 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2869  Hydroxypyruvate reductase  47.64 
 
 		 437 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  44.95 
 
 		 409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0566  hypothetical protein  48.95 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  50.64 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  42.82 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  48.95 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  43.04 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  46.48 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.62 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.62 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  48.84 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  45.22 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  45.13 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  46.7 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  44.06 
 
 		 458 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1042  Hydroxypyruvate reductase  76 
 
 		 263 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  45.86 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  35.77 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  48.65 
 
 		 458 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>