More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4595 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  99.09 
 
 		 221 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  99.09 
 
 		 221 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  89.35 
 
 		 222 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  58.9 
 
 		 221 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  60.19 
 
 		 221 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 221 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  56.68 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 221 aa  234  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  50.68 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  51.14 
 
 		 219 aa  231  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.94 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.94 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  56.42 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  50.46 
 
 		 224 aa  228  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  56.42 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  225  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  51.15 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  52.04 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  54.21 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  48.4 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.24 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.24 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  53.24 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1660  two component transcriptional regulator  57.01 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 		 223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  47.49 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 		 229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 		 229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  53.67 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.9 
 
 		 222 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  44.5 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.12 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.21 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  54.21 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.98 
 
 		 230 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2935  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000047512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 222 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 222 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 222 aa  188  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  44.95 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  46.98 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4140  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.06 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0944225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4344  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000925591  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.37 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4805  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.31 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744128  normal  0.758745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.3 
 
 		 219 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  49.54 
 
 		 219 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  43.58 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.62 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  46.51 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  40.37 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4212  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000202187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  45.29 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1995  two component transcriptional regulator  45.12 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>