More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3365 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3365  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
188 aa  373  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312723  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  74.87 
 
 
183 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.88 
 
 
150 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  40.31 
 
 
141 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
155 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0766  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.61103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  37.5 
 
 
147 aa  99.8  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3453  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.11 
 
 
148 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.879628  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  97.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  46.21 
 
 
145 aa  97.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.53 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  39.53 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  45.45 
 
 
145 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3603  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3446  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5694  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.07 
 
 
156 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3815  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.53 
 
 
141 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4649  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.317237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22810  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
149 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.489543 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4709  transcriptional repressor NsrR  39.53 
 
 
141 aa  95.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.18 
 
 
143 aa  94.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.28 
 
 
153 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.28 
 
 
153 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3513  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.75 
 
 
142 aa  94.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2306  putative transcriptional regulator  46.21 
 
 
139 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  36.09 
 
 
141 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  38.76 
 
 
141 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0693  transcriptional repressor NsrR  36.09 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  38.76 
 
 
141 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  38.76 
 
 
141 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3792  transcriptional repressor NsrR  36.09 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.28 
 
 
153 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4764  transcriptional repressor NsrR  38.76 
 
 
162 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  38.76 
 
 
162 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.5 
 
 
149 aa  91.7  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  38.73 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  38.73 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.93 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  37.06 
 
 
143 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0908  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.65 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  40.46 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  43.36 
 
 
163 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3450  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 
146 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  40.46 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.98 
 
 
143 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  40.46 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  89.4  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0437  transcriptional repressor NsrR  37.21 
 
 
141 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.900839  unclonable  0.0000000282304 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  39.69 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  39.69 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3203  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.4 
 
 
143 aa  87.8  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.98 
 
 
148 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00965194  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.04 
 
 
166 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1843  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.35 
 
 
139 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0056  Rrf2 family protein  37.88 
 
 
151 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0941015  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.93 
 
 
145 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  38.93 
 
 
147 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.3 
 
 
150 aa  85.9  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1628  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.9 
 
 
147 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1476  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.56 
 
 
165 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0550713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.73 
 
 
146 aa  85.1  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.93 
 
 
149 aa  84.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0968  rrf2 family transcriptional regulator  39.85 
 
 
157 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.438038  normal  0.0231013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0932  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.85 
 
 
157 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  84.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2243  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.48 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1866  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.52 
 
 
154 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.92 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4474  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.58 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000199058  hitchhiker  0.00000000296889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.69 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.36 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0043  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.34 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000767573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0043  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.34 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465453  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.34 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4336  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.34 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.312159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  32.84 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2653  hypothetical protein  38.69 
 
 
142 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.87475  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0226  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.61 
 
 
162 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.09 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.36 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.32 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0039  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.83 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.370774  hitchhiker  0.00270297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3804  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.66 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602111  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3286  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.69 
 
 
142 aa  79  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.914657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0763  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.69 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.897031  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4066  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.81 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3341  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.81 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3229  hypothetical protein  33.85 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1690  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.23 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968234  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2020  protein of unknown function UPF0074  35.81 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0041  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.08 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0191012  hitchhiker  0.000277794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0047  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.08 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000883142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2918  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.69 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.996999  normal  0.248939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3702  hypothetical protein  34.59 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>