More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2162 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  97.13 
 
 
284 aa  563  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  97.13 
 
 
284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  89.22 
 
 
275 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  84.19 
 
 
274 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  83.52 
 
 
274 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  71.7 
 
 
277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  69.43 
 
 
277 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  69.05 
 
 
273 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  68.34 
 
 
274 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  68.25 
 
 
275 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  69.44 
 
 
278 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  68.25 
 
 
299 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  71.03 
 
 
279 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  67.59 
 
 
275 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  68.25 
 
 
278 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  64.86 
 
 
275 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  63.5 
 
 
274 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  65.5 
 
 
279 aa  360  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  63.88 
 
 
274 aa  359  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  64.86 
 
 
271 aa  358  5e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  62.93 
 
 
274 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  62.93 
 
 
274 aa  357  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  61.82 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  63.88 
 
 
273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  64.68 
 
 
278 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  60.53 
 
 
274 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  65.84 
 
 
276 aa  340  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  62.7 
 
 
283 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  63.85 
 
 
271 aa  335  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  62.3 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  61.11 
 
 
279 aa  326  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
263 aa  325  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  56.83 
 
 
274 aa  319  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 
269 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  56.86 
 
 
261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  57.72 
 
 
271 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
293 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
293 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
293 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  58.13 
 
 
271 aa  299  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  57.94 
 
 
276 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
259 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  56.33 
 
 
261 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
259 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  54.94 
 
 
266 aa  293  3e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.92 
 
 
261 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  55.24 
 
 
255 aa  290  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.92 
 
 
258 aa  289  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  54.72 
 
 
260 aa  288  9e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  55.73 
 
 
266 aa  288  9e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  56.33 
 
 
260 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  55.79 
 
 
260 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  55.1 
 
 
260 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  56.73 
 
 
260 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  57.2 
 
 
258 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  56.33 
 
 
260 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  56.33 
 
 
260 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  55.92 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  53.73 
 
 
262 aa  284  9e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  57.6 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  54.55 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  55.38 
 
 
284 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  51.59 
 
 
258 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  54.25 
 
 
268 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  55.1 
 
 
267 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  52.09 
 
 
268 aa  278  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
267 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 
268 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  53.72 
 
 
260 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 
268 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  53.06 
 
 
256 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  53.39 
 
 
268 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
268 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
268 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  54.29 
 
 
261 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  53.06 
 
 
261 aa  275  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  52.12 
 
 
268 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  53.05 
 
 
270 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  54 
 
 
274 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  52.71 
 
 
266 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 
263 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  49.23 
 
 
269 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
284 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  49.23 
 
 
269 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  52 
 
 
274 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
272 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
272 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
272 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  52.7 
 
 
263 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
272 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
273 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
272 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
272 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  51.82 
 
 
255 aa  268  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 
275 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1820  methionine aminopeptidase, type I  54.62 
 
 
277 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0935  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
261 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0961494  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3273  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
261 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  52 
 
 
270 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>