55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3818 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3818  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  71.62 
 
 		 83 aa  105  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  69.44 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1045  phage transcriptional regulator, AlpA  66.67 
 
 		 80 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000119119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2832  phage transcriptional regulator, AlpA  52.38 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0794496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  52.73 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  57.14 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  50.91 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  48.44 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  48.21 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  52 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2745  phage transcriptional regulator, AlpA  40.28 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  47.37 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  47.27 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2482  phage transcriptional regulator, AlpA  35.14 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  44.23 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  45.83 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  46.81 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  52.08 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  43.1 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  39.68 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2993  Phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2913  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1454  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3285  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3376  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.605571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1320  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 70 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.362532  normal  0.0773061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  40.35 
 
 		 88 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4141  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0715374  hitchhiker  0.0000772725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2289  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 70 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398001  hitchhiker  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  45.24 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  45.24 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  37.88 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40550  prophage CP4-57 regulatory protein  39.34 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01121  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  36.21 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>