More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3518 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3518  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 312 aa  613  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0947  chromosome replication initiation inhibitor protein  68.39 
 
 		 311 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0095  chromosome replication initiation inhibitor protein  53 
 
 		 304 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  56.4 
 
 		 305 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0149  chromosome replication initiation inhibitor protein  50.79 
 
 		 304 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5010  chromosome replication initiation inhibitor protein  54.67 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.26 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.26 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0399  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.25 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.09 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.35 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.7 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.7 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.35 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.07 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  44.44 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.66 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.97 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.29 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.02 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.62 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3699  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.17 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.792839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.13 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.28 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.96 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2058  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.05 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.52 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.58 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.53 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.91 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.91 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.81 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.5 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4491  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.46 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.07 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  39.13 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.81 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.97 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.83 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.82 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3312  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028913  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.43 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  41.45 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.73 
 
 		 289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.66 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.63 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.94 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.3 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.3 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.3 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.98 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.65 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.34 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.65 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.05 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.65 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.24 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.66 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.66 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.66 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.08 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.66 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.82 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.94 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.34 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.97 
 
 		 297 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1772  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0336  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.07 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.51 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.1 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.4 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.24 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.49 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.99 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.72 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  41.75 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  35 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.46 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.22 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.54 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.2 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.64 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.71 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.5 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.72 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.85 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.01 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.99 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>