More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1341 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  71.71 
 
 
221 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  79.2 
 
 
250 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  80.7 
 
 
274 aa  207  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  80.7 
 
 
262 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  84.21 
 
 
263 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  81.58 
 
 
233 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  67.11 
 
 
289 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  78.86 
 
 
274 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  64.63 
 
 
261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  77.19 
 
 
261 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  63.64 
 
 
146 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  62.94 
 
 
146 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  55.25 
 
 
205 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  60.53 
 
 
203 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  62.76 
 
 
148 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  55.32 
 
 
256 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  58.82 
 
 
213 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  59.87 
 
 
154 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  60.13 
 
 
154 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  58.13 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  61.33 
 
 
152 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  68.7 
 
 
147 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  68.7 
 
 
147 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  68.7 
 
 
147 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  61.33 
 
 
149 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  68.7 
 
 
154 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  57.23 
 
 
151 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  59.52 
 
 
129 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  57.26 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  53.85 
 
 
121 aa  137  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  47.62 
 
 
115 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  48.57 
 
 
117 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  46 
 
 
158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  44.76 
 
 
119 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  42.31 
 
 
115 aa  99  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  41 
 
 
114 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  39.42 
 
 
116 aa  88.2  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  40.86 
 
 
139 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  40.86 
 
 
139 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  40.86 
 
 
158 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  37.25 
 
 
140 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  37.86 
 
 
122 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  35.85 
 
 
118 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  37.25 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  35.85 
 
 
118 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  35.29 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  35.29 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  37.25 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  32.63 
 
 
210 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  35.58 
 
 
123 aa  82  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  33.98 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  33.01 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  33.01 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  33.01 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  36.79 
 
 
117 aa  81.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  33.01 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  35.16 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  35.16 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  37.08 
 
 
131 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  31.73 
 
 
108 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  35 
 
 
105 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  32 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  35.16 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  36.63 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  36.63 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  36.63 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  33.33 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  34 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  32.04 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  34.02 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  32.04 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  38.46 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  35 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  33.64 
 
 
137 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  32.04 
 
 
109 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  32.04 
 
 
109 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  34.31 
 
 
105 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  31.96 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  33.01 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>