More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1025 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  100 
 
 		 297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  86.87 
 
 		 297 aa  494  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  71.72 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  71.38 
 
 		 298 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  71.38 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  66.67 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  56.76 
 
 		 293 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  58.78 
 
 		 296 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  56.08 
 
 		 293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  56.08 
 
 		 293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  58.19 
 
 		 298 aa  325  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  57.43 
 
 		 296 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  54.88 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  61.76 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  59.04 
 
 		 294 aa  318  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  54.97 
 
 		 296 aa  318  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  55.93 
 
 		 288 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  55.37 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  54.03 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  55.74 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  57.09 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  59.12 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  56.08 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  50.81 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  55.14 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  53.82 
 
 		 297 aa  281  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  51.86 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  50.68 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  48.05 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  50.17 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  51.03 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  50.97 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  49.82 
 
 		 292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  45.9 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  49.49 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  49.32 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  47.95 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  49.83 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  43.38 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  41.32 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  45.85 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  46.38 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  44.67 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  44.52 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.24 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  37.72 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  46.46 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.79 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  47.66 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42.7 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  41.81 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  36.64 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  47.89 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  45.13 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.7 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.81 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  43.79 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  43.25 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  44.26 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.15 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  43.54 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  41.92 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  44.1 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  44.1 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  43.06 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.78 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  45.52 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  44.1 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.4 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.03 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.58 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 272 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.28 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  42.55 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  43.4 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.77 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.93 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  43.97 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  43.79 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  45.05 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  43.79 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  43.79 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  45.36 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  41.58 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  45.02 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  42.66 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  42.71 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.11 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  42.76 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  42.76 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  42.76 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  42.76 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.91 
 
 		 279 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  42.76 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  42.76 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  42.76 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>