More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1982 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 423 aa  878    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  57.14 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  57.14 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  57.14 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  56.9 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  56.77 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  56.7 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  56.77 
 
 		 422 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  56.53 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  56.06 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  56.06 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  56.06 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  56.06 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  56.06 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  55.82 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  55.82 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  55.82 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  54.65 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  53.83 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  54.44 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  53.7 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  53.32 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  52.72 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  50.96 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  51.3 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  50.71 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  49.28 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  49.52 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  51.54 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  51.41 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  47.62 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  46.79 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  48 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  44.55 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  44.66 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  44.18 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  45.97 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  43.87 
 
 		 426 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  45.73 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  43.48 
 
 		 449 aa  349  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  43.79 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  44.55 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  43.57 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  41.57 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  42.92 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  45.75 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  43.53 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  42.32 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  45.28 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  44.1 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  42.19 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  42.76 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  41.78 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  43.88 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  41.87 
 
 		 450 aa  322  6e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  43.06 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1200  DNA-directed DNA polymerase  45.07 
 
 		 432 aa  319  7.999999999999999e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  41.18 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  41.26 
 
 		 442 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  40.57 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  40.19 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  42.3 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  40.86 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 		 421 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  41.23 
 
 		 418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  40.71 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  40.9 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0086  ultraviolet light resistance protein B  46.22 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  39.76 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  37.38 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  41 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  41.61 
 
 		 437 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0591  impB/mucB/samB family protein  46.38 
 
 		 366 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  37.03 
 
 		 418 aa  299  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  39.38 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  38.95 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  40.14 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  40.62 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  40.62 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  40.62 
 
 		 418 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  40.14 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  41.94 
 
 		 426 aa  295  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.57 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4268  DNA-repair protein  42.52 
 
 		 382 aa  292  8e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  39.9 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  41.33 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  40.24 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  38.48 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  40.86 
 
 		 418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  41.09 
 
 		 418 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  40.66 
 
 		 436 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>