More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1628 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  100 
 
 
316 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  55.29 
 
 
317 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  56.48 
 
 
313 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  52.43 
 
 
316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  52.43 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  53.38 
 
 
301 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  36.15 
 
 
323 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
317 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
317 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  36.08 
 
 
317 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  39.06 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  38.72 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.72 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  36.77 
 
 
335 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.71 
 
 
331 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  34.63 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  33.8 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  35.71 
 
 
335 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  32.81 
 
 
317 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  35.29 
 
 
333 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  33.67 
 
 
322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
312 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
312 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  32 
 
 
316 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  32.65 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  34.83 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  32.51 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  30.87 
 
 
332 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  31.23 
 
 
354 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  31.23 
 
 
354 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  31.23 
 
 
354 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  31.23 
 
 
354 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
354 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
354 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
354 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  31.21 
 
 
350 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
324 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
354 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
354 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.75 
 
 
356 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  33.33 
 
 
415 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  32.19 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  34.9 
 
 
326 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  31.94 
 
 
354 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  32.28 
 
 
314 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  35.1 
 
 
318 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  35.1 
 
 
318 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  33.22 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  31.94 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  33.45 
 
 
346 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  29.41 
 
 
316 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  30.88 
 
 
354 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.29 
 
 
362 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  28.9 
 
 
316 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  33.33 
 
 
366 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 
316 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  28.8 
 
 
369 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  29.51 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  28.77 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  30.66 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  30.34 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.99 
 
 
694 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  24.68 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.25 
 
 
696 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  24.29 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.25 
 
 
696 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.25 
 
 
696 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  24.29 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  27.24 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.99 
 
 
696 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  24 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  24 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  24.83 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  24 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  24 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  25 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.91 
 
 
696 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  27.74 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  24.25 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  24.25 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  25.67 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.42 
 
 
697 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.42 
 
 
708 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  27.3 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.09 
 
 
697 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  23.47 
 
 
350 aa  62.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.56 
 
 
706 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.56 
 
 
706 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.7 
 
 
671 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.56 
 
 
706 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.47 
 
 
659 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  26.86 
 
 
704 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  21.96 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.56 
 
 
706 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.56 
 
 
706 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.94 
 
 
706 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.56 
 
 
706 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>