More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2444 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
320 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
292 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.9 
 
 
1161 aa  99  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.62 
 
 
1162 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
327 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
327 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.29 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.63 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.63 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.29 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
1061 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.15 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.71 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
235 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
528 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  24.1 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  24.1 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  26.56 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  26.56 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  24.1 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  26.56 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  39.8 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
1301 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
233 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
710 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0802  glycosyl transferase family 2  44.57 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  23.39 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.91 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  23.69 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.07 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
357 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
238 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
988 aa  62.8  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  36.26 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.52 
 
 
326 aa  62.4  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
717 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  34.91 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
857 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.64 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  28.46 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
1116 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.23 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
455 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  26.52 
 
 
792 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
344 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  34.07 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
1002 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.19 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
717 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 
373 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  27.52 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  29.49 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
352 aa  59.3  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.32 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
398 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>