More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0858 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  67.33 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  54 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  58.16 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  44.14 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.12 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  53.85 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.12 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  56.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  53.06 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0416  50S ribosomal protein L24P  53.92 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.227235 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 102 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0767  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0158392  normal  0.0806837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  48.35 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>