153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1766 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1766  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
212 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0137  cobalt transport protein CbiM  93.4 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  77.83 
 
 
212 aa  353  6.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  71.22 
 
 
210 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1480  cobalt transport protein CbiM  55.66 
 
 
213 aa  246  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2621  cobalt transport protein CbiM  52.86 
 
 
214 aa  229  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.78373  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1402  cobalt transport protein CbiM  58.54 
 
 
212 aa  227  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1793  cobalt transport protein CbiM  54.42 
 
 
218 aa  203  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000128429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.1 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.31 
 
 
246 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.38 
 
 
241 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.38 
 
 
241 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.38 
 
 
213 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.93 
 
 
328 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.9 
 
 
204 aa  145  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.67 
 
 
326 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.15 
 
 
310 aa  132  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.84 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.81 
 
 
299 aa  131  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  43.32 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.1 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.45 
 
 
232 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.45 
 
 
232 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.99 
 
 
233 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.45 
 
 
232 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.33 
 
 
229 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.91 
 
 
306 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.46 
 
 
235 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.5 
 
 
307 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4293  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.42 
 
 
230 aa  121  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.43 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.54 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  34.48 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.31 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.27 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.45 
 
 
219 aa  115  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0213  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.51 
 
 
202 aa  115  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.655003  normal  0.171707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.36 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.67 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1327  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.27 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.25 
 
 
344 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  35.81 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.48 
 
 
355 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3837300000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  32.76 
 
 
242 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
230 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  36.28 
 
 
229 aa  105  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
226 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2225  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.14 
 
 
359 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000325574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0330  cobalt transport protein CbiM  31.98 
 
 
325 aa  100  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.43 
 
 
354 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1279  cobalamin biosynthesis protein CbiM, putative  33.65 
 
 
343 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0499926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  32.17 
 
 
330 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.46 
 
 
232 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.72 
 
 
333 aa  99.4  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.94 
 
 
231 aa  99  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  30.7 
 
 
352 aa  98.6  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  35.68 
 
 
256 aa  98.2  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  34.21 
 
 
245 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.11 
 
 
347 aa  96.7  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.09 
 
 
352 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  33.33 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  35.05 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  31.56 
 
 
235 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2769  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.39 
 
 
342 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1450  cobalt transport protein CbiM  39.37 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.208192  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.73 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.67 
 
 
421 aa  95.5  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2441  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.88 
 
 
346 aa  95.5  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.18 
 
 
348 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000017293  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1116  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.7 
 
 
238 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  31.78 
 
 
321 aa  94.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  30.94 
 
 
235 aa  94.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  32.03 
 
 
251 aa  94.7  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1805  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.74 
 
 
341 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  36.89 
 
 
301 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.43 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1006  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.4 
 
 
238 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  32.74 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  30.26 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.29 
 
 
348 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1243  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.86 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000323865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  28.19 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11090  cobalt transport protein CbiM  28.05 
 
 
339 aa  89.4  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000340042  normal  0.0123253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.82 
 
 
250 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  34.1 
 
 
249 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  32.74 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  33.65 
 
 
225 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  33.18 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  32.71 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2005  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.63 
 
 
343 aa  85.5  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0387041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.56 
 
 
337 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  31.07 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0492  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.41 
 
 
337 aa  85.1  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.267913  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0185  cobalt transport protein CbiM  33.79 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.878644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0182  cobalt transport protein CbiM  33.79 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  30.48 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.48 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  33.81 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  30.45 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>