36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0774 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  78.95 
 
 
209 aa  337  5e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  59.71 
 
 
204 aa  248  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  51.05 
 
 
198 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.15 
 
 
197 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.74 
 
 
191 aa  178  6e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  43.15 
 
 
195 aa  170  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.47 
 
 
190 aa  65.1  7e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.56 
 
 
189 aa  60.1  2e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.86 
 
 
210 aa  57  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.96 
 
 
198 aa  54.7  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.86 
 
 
198 aa  54.3  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.87 
 
 
190 aa  53.1  3e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 
190 aa  52.4  5e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  3.42837e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  22.51 
 
 
202 aa  50.1  2e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  21.08 
 
 
189 aa  50.1  2e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.85 
 
 
205 aa  49.7  3e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  25.85 
 
 
197 aa  48.9  5e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  21.5 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  20.19 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  21.81 
 
 
190 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.4 
 
 
193 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  21.65 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  21.95 
 
 
553 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  19.38 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.14 
 
 
559 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.77 
 
 
172 aa  45.1  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.24 
 
 
550 aa  44.7  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  21.84 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.98 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.6 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  23.28 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  23.23 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.61 
 
 
544 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  20.94 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  20.94 
 
 
196 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>