175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0704 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
423 aa  809    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  93.14 
 
 
423 aa  735    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  94.56 
 
 
423 aa  745    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  73.14 
 
 
429 aa  586  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  60.78 
 
 
433 aa  473  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
539 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
519 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
506 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  25.87 
 
 
506 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  25.87 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  26.41 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  26.56 
 
 
510 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.2 
 
 
506 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.36 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.36 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  26.36 
 
 
506 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  25.91 
 
 
506 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
534 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  21.99 
 
 
517 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
535 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  23.61 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
506 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 
506 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  22.27 
 
 
513 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  23.38 
 
 
459 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 
500 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  23.09 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  22.66 
 
 
459 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  22.66 
 
 
459 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  22.66 
 
 
459 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  23.09 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  23.15 
 
 
459 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  22.2 
 
 
459 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  30.67 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
489 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
564 aa  63.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  22.57 
 
 
554 aa  63.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
459 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  24.16 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  24.52 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.52 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  24.52 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  24.52 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  24.52 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
517 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  22.44 
 
 
544 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.52 
 
 
550 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 
514 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 
544 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  22.44 
 
 
544 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 
522 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  21.8 
 
 
544 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
446 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
529 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  22.44 
 
 
544 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 
550 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  22.22 
 
 
544 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  24.05 
 
 
550 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  24.05 
 
 
550 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
544 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  22.01 
 
 
544 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
482 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  22.01 
 
 
544 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 
429 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 
550 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.28 
 
 
488 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  23.08 
 
 
519 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  23.54 
 
 
519 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 
495 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
553 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
553 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  21.65 
 
 
647 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  29.27 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
495 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  21.91 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.18 
 
 
517 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  24.44 
 
 
543 aa  53.9  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  22.38 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  23.71 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
482 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>