130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0388 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1390  polysaccharide biosynthesis protein, putative  59.89 
 
 
544 aa  673    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.106495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  100 
 
 
543 aa  1082    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1986  hypothetical protein  44.13 
 
 
557 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  38.88 
 
 
552 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  39.59 
 
 
549 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  34.69 
 
 
647 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  34.52 
 
 
554 aa  283  6.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  33.03 
 
 
542 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  31.09 
 
 
550 aa  258  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  30.09 
 
 
550 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  29.91 
 
 
550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  30.34 
 
 
550 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0493  polysaccharide transporter  34.42 
 
 
527 aa  243  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  31.86 
 
 
544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 
550 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  32.04 
 
 
544 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  32.78 
 
 
544 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  32.6 
 
 
544 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  31.92 
 
 
544 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  31.92 
 
 
544 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  32.55 
 
 
544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  31.68 
 
 
544 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  32.42 
 
 
544 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  32.84 
 
 
541 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  30.41 
 
 
550 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  30.22 
 
 
550 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  30.41 
 
 
550 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  30.41 
 
 
550 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  30.41 
 
 
550 aa  226  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  30.41 
 
 
550 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 
553 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 
553 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 
553 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0905  polysaccharide transporter  31.15 
 
 
484 aa  189  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  31.19 
 
 
459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  29.91 
 
 
459 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  29.98 
 
 
459 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  29.61 
 
 
459 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  29.91 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  29.69 
 
 
459 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  29.69 
 
 
459 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  29.69 
 
 
459 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  29.98 
 
 
459 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  29.98 
 
 
459 aa  180  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  29.96 
 
 
459 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
535 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 
564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
529 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  24.5 
 
 
510 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  25.99 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  25.27 
 
 
544 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  25.7 
 
 
517 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
539 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
506 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  25.53 
 
 
506 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
535 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
519 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 
526 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.47 
 
 
506 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  25.43 
 
 
506 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
533 aa  99.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  24.81 
 
 
506 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
506 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  23.19 
 
 
533 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  23.57 
 
 
533 aa  97.4  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  23.57 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  23.57 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  26.19 
 
 
506 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0061  polysaccharide synthase family protein  23.57 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  27.65 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  31.11 
 
 
533 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  29.52 
 
 
533 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
522 aa  95.9  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0064  polysaccharide synthase family protein  31.46 
 
 
533 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  25.96 
 
 
506 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  25.96 
 
 
506 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
506 aa  91.3  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  35.33 
 
 
517 aa  89.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  21.96 
 
 
512 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1413  stage V sporulation protein B  20.4 
 
 
538 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.208509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1223  stage V sporulation protein B  20.18 
 
 
538 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.30797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  25.75 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0050  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
516 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0052  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
526 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 
508 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
513 aa  74.3  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  29.78 
 
 
520 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  22.81 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  25.47 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  25.53 
 
 
519 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  25.74 
 
 
519 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>