More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0043 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  94.69 
 
 
414 aa  802  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  82.81 
 
 
414 aa  725  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  94.93 
 
 
414 aa  806  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
414 aa  842  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  66.1 
 
 
419 aa  575  1e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 
408 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  49.04 
 
 
412 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  45.76 
 
 
404 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  47.55 
 
 
404 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  48.3 
 
 
405 aa  358  7e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  46.86 
 
 
413 aa  358  8e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  46.49 
 
 
413 aa  357  1e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  48.16 
 
 
407 aa  349  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  47.58 
 
 
388 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  44.25 
 
 
404 aa  338  8e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  45.26 
 
 
409 aa  338  1e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  42.86 
 
 
408 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  42.75 
 
 
415 aa  330  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  45.15 
 
 
409 aa  329  5e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  42.26 
 
 
412 aa  325  9e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  39.52 
 
 
408 aa  302  7e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 
407 aa  298  1e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
411 aa  274  2e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  39.55 
 
 
408 aa  272  7e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  39.7 
 
 
408 aa  271  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  38.59 
 
 
408 aa  260  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  39.71 
 
 
397 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 
393 aa  255  1e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  38.94 
 
 
394 aa  252  8e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.07 
 
 
650 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.13 
 
 
646 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.48 
 
 
655 aa  244  2e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  39.32 
 
 
393 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  37.83 
 
 
397 aa  243  4e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
397 aa  242  8e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
393 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  38.69 
 
 
396 aa  241  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  37.65 
 
 
393 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  38.28 
 
 
394 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  38.1 
 
 
399 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 
393 aa  239  1e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 
399 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  38.07 
 
 
396 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
394 aa  235  1e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  38.37 
 
 
401 aa  235  1e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
394 aa  235  1e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  37.2 
 
 
394 aa  234  2e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.83752e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  37.5 
 
 
394 aa  234  2e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  36.96 
 
 
394 aa  234  2e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
394 aa  234  2e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.43166e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  37.26 
 
 
394 aa  234  2e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  36.67 
 
 
397 aa  234  2e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
394 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.25846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  36.14 
 
 
394 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
394 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  8.97427e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  36.8 
 
 
394 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  36.34 
 
 
393 aa  233  7e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
394 aa  233  7e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
394 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  35.55 
 
 
395 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.8 
 
 
400 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 
395 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.08196e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  36.36 
 
 
407 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  36.93 
 
 
397 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  36.3 
 
 
402 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  35.21 
 
 
407 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  36.87 
 
 
392 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  36.56 
 
 
389 aa  227  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  36.9 
 
 
394 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  35.65 
 
 
395 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  34.62 
 
 
403 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  37.71 
 
 
399 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  34.68 
 
 
395 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  38.33 
 
 
405 aa  223  5e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  35.08 
 
 
398 aa  223  5e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  36.93 
 
 
400 aa  223  5e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  8.1291e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  35.24 
 
 
443 aa  222  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  35.24 
 
 
402 aa  222  1e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  38.04 
 
 
400 aa  221  2e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  36.67 
 
 
403 aa  221  2e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  38.04 
 
 
400 aa  221  2e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  37.71 
 
 
402 aa  221  2e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 
397 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  37.2 
 
 
401 aa  220  4e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  35.41 
 
 
395 aa  220  4e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 
403 aa  219  9e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  35.15 
 
 
400 aa  219  9e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  37.38 
 
 
397 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  34.84 
 
 
397 aa  217  3e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2891  phosphoglycerate kinase  36.19 
 
 
392 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  36.8 
 
 
435 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3701  phosphoglycerate kinase  34.83 
 
 
387 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  37.08 
 
 
401 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  36.93 
 
 
399 aa  216  6e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  37.38 
 
 
402 aa  216  6e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  35.41 
 
 
396 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  35.41 
 
 
396 aa  215  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  34.7 
 
 
396 aa  215  1e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  35.49 
 
 
397 aa  215  1e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0849  phosphoglycerate kinase  35.63 
 
 
387 aa  214  2e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>