More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06770 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06770  ribosome recycling factor  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000531316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1387  ribosome recycling factor  72.43 
 
 
185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1370  ribosome recycling factor  71.89 
 
 
185 aa  280  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  63.24 
 
 
185 aa  249  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23580  ribosome recycling factor  61.08 
 
 
185 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.275445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1418  ribosome recycling factor  60 
 
 
185 aa  240  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.441102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11220  ribosome recycling factor  60.33 
 
 
186 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0977787  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  60 
 
 
185 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  57.84 
 
 
185 aa  233  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1007  ribosome recycling factor  60 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  57.3 
 
 
185 aa  231  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1487  ribosome recycling factor  60.54 
 
 
185 aa  231  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1532  ribosome recycling factor  57.84 
 
 
185 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0437112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  56.22 
 
 
185 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  54.59 
 
 
185 aa  222  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  57.3 
 
 
185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  54.05 
 
 
185 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2504  ribosome recycling factor  56.22 
 
 
185 aa  221  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  52.43 
 
 
185 aa  218  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  52.43 
 
 
185 aa  217  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  54.59 
 
 
185 aa  217  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0806  ribosome recycling factor  55 
 
 
184 aa  214  5.9999999999999996e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2201  ribosome recycling factor  53.51 
 
 
185 aa  214  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1233  ribosome recycling factor  54.05 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.408531  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  51.35 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  52.97 
 
 
185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1325  ribosome recycling factor  53.51 
 
 
185 aa  210  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  51.89 
 
 
185 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  51.89 
 
 
185 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  51.89 
 
 
185 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  51.35 
 
 
185 aa  204  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0407  ribosome recycling factor  53.89 
 
 
183 aa  201  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00332415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  51.35 
 
 
185 aa  201  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  49.19 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  49.19 
 
 
185 aa  197  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  48.11 
 
 
185 aa  197  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10150  ribosome recycling factor  49.72 
 
 
188 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3407  ribosome recycling factor  52.97 
 
 
185 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0276302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  47.57 
 
 
184 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  46.49 
 
 
185 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  49.19 
 
 
185 aa  184  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  47.03 
 
 
185 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.95 
 
 
185 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.7 
 
 
184 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.57 
 
 
186 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  49.14 
 
 
176 aa  177  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  44.86 
 
 
185 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  45.65 
 
 
192 aa  175  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  45.41 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  43.48 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  45.41 
 
 
185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  45.41 
 
 
185 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  45.11 
 
 
184 aa  170  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  47.78 
 
 
187 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  43.58 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  44.86 
 
 
185 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  43.58 
 
 
186 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  44.13 
 
 
186 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  44.86 
 
 
185 aa  168  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  45.41 
 
 
185 aa  168  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  42.39 
 
 
186 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  45 
 
 
182 aa  167  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
185 aa  167  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  167  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  167  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
185 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  45.11 
 
 
186 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  43.58 
 
 
186 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  42.16 
 
 
185 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  42.16 
 
 
185 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  44.44 
 
 
182 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1992  ribosome recycling factor  44.02 
 
 
186 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  44.44 
 
 
186 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  46.02 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  45.25 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  43.58 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  41.62 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  45.56 
 
 
181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  41.62 
 
 
185 aa  165  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  43.24 
 
 
185 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  43.48 
 
 
185 aa  164  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  43.78 
 
 
185 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  44.86 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>