165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0964 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 543 aa  1121    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.57 
 
 		 528 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  41.63 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.31 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  46.67 
 
 		 552 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  47.04 
 
 		 546 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  50 
 
 		 560 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  48.12 
 
 		 498 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  47.78 
 
 		 498 aa  281  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  47.78 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  47.78 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.78 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  47.78 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  47.78 
 
 		 506 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  47.78 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  47.78 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  44.87 
 
 		 553 aa  279  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  47.44 
 
 		 498 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  47.44 
 
 		 498 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  47.44 
 
 		 498 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  47.1 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  46.48 
 
 		 499 aa  276  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  46.83 
 
 		 499 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  45.21 
 
 		 553 aa  273  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  46.88 
 
 		 523 aa  273  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  46.02 
 
 		 498 aa  266  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  45.77 
 
 		 512 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  45.77 
 
 		 512 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  44.37 
 
 		 498 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  49.62 
 
 		 468 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  45.42 
 
 		 512 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  44.37 
 
 		 499 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  40.8 
 
 		 509 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  40.47 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  42 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  37.39 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  38.26 
 
 		 547 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  40.71 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  37.86 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.94 
 
 		 375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  35.23 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  38.52 
 
 		 464 aa  183  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  36.36 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.05 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.45 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.42 
 
 		 436 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.25 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.58 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.61 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.21 
 
 		 382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  32 
 
 		 390 aa  127  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  36.65 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  38.29 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  37.04 
 
 		 368 aa  100  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  39.04 
 
 		 368 aa  100  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  35.4 
 
 		 379 aa  88.6  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.04 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  23.42 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.17 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  21.43 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.38 
 
 		 285 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  25.16 
 
 		 308 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  23.48 
 
 		 309 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23 
 
 		 306 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.45 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.67 
 
 		 302 aa  53.5  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0408  ATPase  22.9 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00606389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  23.11 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.34 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.34 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  24.53 
 
 		 324 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.14 
 
 		 326 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  23.83 
 
 		 313 aa  51.2  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.22 
 
 		 325 aa  50.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.49 
 
 		 432 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.34 
 
 		 345 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  21.99 
 
 		 309 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.57 
 
 		 320 aa  50.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  23.37 
 
 		 330 aa  50.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  23.31 
 
 		 320 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  22.08 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  21.65 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  22.4 
 
 		 309 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  26.91 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.43 
 
 		 331 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.97 
 
 		 328 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  22.05 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  22.05 
 
 		 320 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  23.57 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  22.05 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4419  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  23.39 
 
 		 336 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.3 
 
 		 342 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  22.4 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.78 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  21.99 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.44 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.11 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  21.99 
 
 		 309 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>