More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0091 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0726  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  85.05 
 
 
515 aa  780  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0091  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
507 aa  1004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0120  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  88.04 
 
 
510 aa  808  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.301316  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0110  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
507 aa  1004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.196213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0101  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
507 aa  1004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0547  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  71.09 
 
 
511 aa  650  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  68.48 
 
 
513 aa  649  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.06 
 
 
509 aa  637  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  74.11 
 
 
508 aa  702  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.06 
 
 
510 aa  645  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.27 
 
 
509 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.01 
 
 
510 aa  628  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.19 
 
 
508 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.58371e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.39 
 
 
508 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1814  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.8 
 
 
518 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493223  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.81 
 
 
508 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.6 
 
 
509 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.35581e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.81 
 
 
508 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.6 
 
 
509 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.6 
 
 
509 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.01 
 
 
510 aa  621  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.6 
 
 
509 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.81 
 
 
508 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.69 
 
 
508 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.81 
 
 
508 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.52 
 
 
512 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.07865e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.01 
 
 
510 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.01 
 
 
510 aa  621  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.01 
 
 
510 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  63.01 
 
 
510 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.23 
 
 
528 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  62.82 
 
 
510 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.82 
 
 
510 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.35 
 
 
508 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  63.76 
 
 
518 aa  614  1e-174  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.96 
 
 
508 aa  614  1e-174  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.95 
 
 
518 aa  611  1e-174  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.18 
 
 
518 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.8 
 
 
508 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0931  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  61.78 
 
 
518 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.867027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.6 
 
 
508 aa  582  1e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.8 
 
 
508 aa  584  1e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.6 
 
 
508 aa  583  1e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.89 
 
 
509 aa  581  1e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.33 
 
 
517 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  61.57 
 
 
509 aa  577  1e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.34 
 
 
509 aa  576  1e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.33 
 
 
509 aa  574  1e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2585  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.82 
 
 
509 aa  574  1e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1861  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.43 
 
 
509 aa  574  1e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2078  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.04 
 
 
509 aa  569  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0566  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.19 
 
 
514 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0260  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.12 
 
 
494 aa  571  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1756  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.43 
 
 
514 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.814968  normal  0.67864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2831  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.05 
 
 
514 aa  557  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1076  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.45 
 
 
518 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.95 
 
 
512 aa  539  1e-152  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2246  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  54.6 
 
 
523 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07820  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  55.98 
 
 
519 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.35 
 
 
522 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.92 
 
 
523 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.88 
 
 
520 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  3.19763e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.67 
 
 
524 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.48 
 
 
523 aa  506  1e-142  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.67 
 
 
523 aa  506  1e-142  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24210  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.88 
 
 
511 aa  508  1e-142  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.2 
 
 
518 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.62 
 
 
538 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52 
 
 
523 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0708  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.34 
 
 
524 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368704  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.71 
 
 
525 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.7 
 
 
524 aa  493  1e-138  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5542  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.35 
 
 
533 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5778  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.53 
 
 
543 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809454  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  53.85 
 
 
518 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.99 
 
 
524 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3754  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.8 
 
 
549 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1653  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.77 
 
 
529 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.46455  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7228  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.21 
 
 
530 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.5 
 
 
538 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2265  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.37 
 
 
517 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.39241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.97 
 
 
532 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  46.25 
 
 
1128 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  46.99 
 
 
1060 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10581  predicted protein  41.5 
 
 
533 aa  362  7e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1435  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.6 
 
 
374 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4662  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.46 
 
 
375 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.320947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3968  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.98 
 
 
375 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52416  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0114  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.06 
 
 
373 aa  328  2e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1415  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.92 
 
 
374 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.79 
 
 
373 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0973  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  48.5 
 
 
429 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1227  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.38 
 
 
376 aa  326  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0175  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.79 
 
 
373 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0913  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  48.5 
 
 
476 aa  326  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5070  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.79 
 
 
373 aa  326  8e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0853824  hitchhiker  0.00742692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  48.52 
 
 
373 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1384  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.77 
 
 
440 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0995  alanine dehydrogenase/PNT  48.38 
 
 
376 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2547  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50 
 
 
376 aa  323  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>