More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1756 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.89 
 
 
510 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  67.89 
 
 
510 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.31 
 
 
528 aa  686    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.08 
 
 
509 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.54 
 
 
508 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.05 
 
 
508 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1756  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 
514 aa  1034    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.814968  normal  0.67864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.38 
 
 
508 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000358371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.64 
 
 
508 aa  673    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2831  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  94.75 
 
 
514 aa  962    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.89 
 
 
510 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.86 
 
 
518 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.64 
 
 
508 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.89 
 
 
510 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.89 
 
 
510 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.7 
 
 
510 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.28 
 
 
509 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.6 
 
 
509 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.7 
 
 
509 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.28 
 
 
509 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000435581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.02 
 
 
508 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.64 
 
 
508 aa  673    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.6 
 
 
509 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.54 
 
 
518 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.09 
 
 
509 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  66.92 
 
 
518 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  67.89 
 
 
510 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.64 
 
 
508 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.09 
 
 
509 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.22 
 
 
512 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000307865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.74 
 
 
508 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.48 
 
 
510 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.83 
 
 
508 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.64 
 
 
508 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.7 
 
 
510 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.54 
 
 
509 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.54 
 
 
508 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.83 
 
 
508 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.96 
 
 
509 aa  631  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2585  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.64 
 
 
509 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60.92 
 
 
522 aa  628  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0931  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.89 
 
 
518 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.867027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2078  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.44 
 
 
509 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  62.57 
 
 
520 aa  625  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000319763  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1861  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.83 
 
 
509 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.88 
 
 
512 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0566  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.32 
 
 
514 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.97 
 
 
524 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.63 
 
 
523 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.78 
 
 
518 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.82 
 
 
523 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.44 
 
 
523 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.25 
 
 
523 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.46 
 
 
525 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.5 
 
 
524 aa  528  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.98 
 
 
532 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.03 
 
 
538 aa  528  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0547  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  57.28 
 
 
511 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  54.63 
 
 
513 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0708  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.64 
 
 
524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368704  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  55.85 
 
 
508 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0091  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.24 
 
 
507 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0101  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.24 
 
 
507 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0110  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.24 
 
 
507 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.196213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0726  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.31 
 
 
515 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1653  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.66 
 
 
529 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.46455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0120  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.59 
 
 
510 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.301316  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3754  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.99 
 
 
549 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1814  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.58 
 
 
518 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0260  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.11 
 
 
494 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.35 
 
 
524 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5542  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.63 
 
 
533 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5778  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54 
 
 
543 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809454  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.4 
 
 
517 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07820  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  50.48 
 
 
519 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1076  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.32 
 
 
518 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2246  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  48.12 
 
 
523 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7228  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.62 
 
 
530 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24210  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.19 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  48.29 
 
 
518 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10581  predicted protein  45.13 
 
 
533 aa  441  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2265  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.92 
 
 
517 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.39241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.71 
 
 
538 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158107 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  45.61 
 
 
1060 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  44.92 
 
 
1128 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4265  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.38 
 
 
388 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  47.75 
 
 
373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0956  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.47 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00245688  hitchhiker  0.000000175975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4431  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.77 
 
 
373 aa  309  9e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.447977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0691  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.49 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144768  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0216  alanine dehydrogenase/PNT-like  47.01 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0700  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.01 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0667  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.01 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2058  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.48 
 
 
377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000804749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2896  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.04 
 
 
385 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01860  NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  45.91 
 
 
390 aa  306  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0301243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3200  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.04 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0144615  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0275  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.13 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0114  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.54 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02450  putative NAD(P) transhydrogenase, subunit alpha part 1  46.13 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>