More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3081 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.63 
 
 		 510 aa  745    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  73.63 
 
 		 510 aa  745    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1756  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.83 
 
 		 514 aa  666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.814968  normal  0.67864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.63 
 
 		 510 aa  745    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.96 
 
 		 509 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2831  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  68.6 
 
 		 514 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  65.69 
 
 		 509 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  95.67 
 
 		 508 aa  957    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.63 
 
 		 510 aa  745    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  92.11 
 
 		 508 aa  932    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000358371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0566  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.45 
 
 		 514 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  73.63 
 
 		 510 aa  745    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  92.32 
 
 		 508 aa  930    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2585  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.02 
 
 		 509 aa  680    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  92.32 
 
 		 508 aa  930    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.27 
 
 		 508 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.23 
 
 		 509 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000435581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.07 
 
 		 509 aa  693    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.49 
 
 		 510 aa  745    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1861  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.43 
 
 		 509 aa  678    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.59 
 
 		 528 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.23 
 
 		 509 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.57 
 
 		 512 aa  711    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000307865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  92.32 
 
 		 508 aa  930    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.88 
 
 		 508 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.62 
 
 		 518 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.23 
 
 		 509 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0931  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  81.47 
 
 		 518 aa  826    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.867027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  92.32 
 
 		 508 aa  930    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.82 
 
 		 509 aa  690    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.49 
 
 		 510 aa  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.29 
 
 		 518 aa  697    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  88.39 
 
 		 508 aa  894    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2078  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.65 
 
 		 509 aa  673    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.37 
 
 		 510 aa  728    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 508 aa  1026    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  99.61 
 
 		 508 aa  1022    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.23 
 
 		 509 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  85.07 
 
 		 509 aa  882    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  71.29 
 
 		 518 aa  693    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.88 
 
 		 508 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.79 
 
 		 510 aa  754    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  99.21 
 
 		 508 aa  1018    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.48 
 
 		 509 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.78 
 
 		 522 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.94 
 
 		 524 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60.27 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000319763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0726  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.47 
 
 		 515 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0110  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.73 
 
 		 507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.196213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0091  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.73 
 
 		 507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0101  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.73 
 
 		 507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0547  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  62.18 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.28 
 
 		 523 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.89 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  57.62 
 
 		 513 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.75 
 
 		 538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.56 
 
 		 523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.75 
 
 		 523 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.32 
 
 		 523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0120  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.13 
 
 		 510 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.301316  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.83 
 
 		 524 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.56 
 
 		 525 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  58.74 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1814  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  61.24 
 
 		 518 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493223  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.88 
 
 		 524 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2246  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  52.84 
 
 		 523 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58 
 
 		 518 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0708  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.02 
 
 		 524 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1653  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.77 
 
 		 529 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.46455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.34 
 
 		 532 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.65 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07820  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  52.69 
 
 		 519 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5542  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.49 
 
 		 533 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0260  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.89 
 
 		 494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1076  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.07 
 
 		 518 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3754  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.11 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5778  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.49 
 
 		 543 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809454  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7228  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.64 
 
 		 530 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24210  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.62 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  52.21 
 
 		 518 aa  491  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2265  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  51.06 
 
 		 517 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.39241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.35 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158107 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  50.1 
 
 		 1060 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10581  predicted protein  45.81 
 
 		 533 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  46.27 
 
 		 1128 aa  428  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2547  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  49.46 
 
 		 376 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1435  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.68 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1415  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.22 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1948  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.92 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2058  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.43 
 
 		 377 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000804749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4662  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.22 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.320947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0995  alanine dehydrogenase/PNT  47.03 
 
 		 376 aa  315  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2183  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.71 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1227  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.68 
 
 		 376 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0891  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.63 
 
 		 378 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861705  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5070  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.82 
 
 		 373 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0853824  hitchhiker  0.00742692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4431  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.36 
 
 		 373 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.447977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  46.63 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0956  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  44.88 
 
 		 391 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00245688  hitchhiker  0.000000175975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.82 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>