More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_25840 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  50.89 
 
 
1060 aa  971    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  100 
 
 
1128 aa  2274    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.01 
 
 
512 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.04 
 
 
510 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.13 
 
 
528 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  46.67 
 
 
510 aa  438  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.67 
 
 
510 aa  438  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.94 
 
 
522 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.67 
 
 
510 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.67 
 
 
510 aa  438  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.48 
 
 
510 aa  436  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.68 
 
 
510 aa  436  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  46.48 
 
 
510 aa  436  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.62 
 
 
509 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.58 
 
 
462 aa  432  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.22 
 
 
524 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  49.37 
 
 
462 aa  430  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.2 
 
 
518 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.44 
 
 
509 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.44 
 
 
509 aa  426  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.25 
 
 
509 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.25 
 
 
509 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000435581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.56 
 
 
508 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.83 
 
 
464 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.83 
 
 
464 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.37 
 
 
508 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.83 
 
 
464 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.37 
 
 
508 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.1 
 
 
508 aa  423  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.08 
 
 
508 aa  423  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000358371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.37 
 
 
508 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.37 
 
 
508 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.13 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.25 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.25 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.25 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.04 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46 
 
 
508 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46 
 
 
508 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.25 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.97 
 
 
458 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.42 
 
 
508 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.03 
 
 
510 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.39 
 
 
509 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.83 
 
 
457 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.45 
 
 
520 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000319763  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.81 
 
 
469 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.95 
 
 
509 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.61 
 
 
464 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44 
 
 
525 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.36 
 
 
523 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.25 
 
 
494 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  47.76 
 
 
458 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.45 
 
 
509 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.62 
 
 
462 aa  409  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  47.5 
 
 
518 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  48.09 
 
 
458 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.48 
 
 
508 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07830  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  47.93 
 
 
472 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.03 
 
 
494 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.11 
 
 
508 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.54 
 
 
458 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.11 
 
 
508 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.55 
 
 
462 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.97 
 
 
518 aa  405  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.74 
 
 
464 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.96 
 
 
518 aa  403  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.01 
 
 
512 aa  403  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000307865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.05 
 
 
469 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.74 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.15 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2400  pyridine nucleotide transhydrogenase  47.33 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.94 
 
 
494 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.74 
 
 
509 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.67 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  44.4 
 
 
524 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1862  pyridine nucleotide transhydrogenase  49.25 
 
 
462 aa  403  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.534712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.15 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.15 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.15 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.25 
 
 
466 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.39 
 
 
481 aa  403  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.94 
 
 
494 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.94 
 
 
494 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.67 
 
 
523 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.33 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2245  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.74 
 
 
468 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.16 
 
 
538 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2266  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.3 
 
 
462 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.366293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.64 
 
 
466 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.55 
 
 
509 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.17 
 
 
465 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.85 
 
 
524 aa  396  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>