More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05733 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01572  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.66 
 
 		 510 aa  772    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2040  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  74.85 
 
 		 510 aa  773    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0791488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3417  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.71 
 
 		 508 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.642458  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0497  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  86.49 
 
 		 512 aa  864    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000307865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2313  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.57 
 
 		 528 aa  777    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.530452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1596  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.85 
 
 		 510 aa  773    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.67 
 
 		 509 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1862  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.27 
 
 		 509 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3740  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.87 
 
 		 508 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1849  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.64 
 
 		 509 aa  705    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269464  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2108  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.32 
 
 		 509 aa  725    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.096772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1588  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.27 
 
 		 509 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00820471  normal  0.701407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01562  hypothetical protein  74.66 
 
 		 510 aa  772    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1941  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.66 
 
 		 508 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1789  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.47 
 
 		 510 aa  768    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.334141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1756  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.54 
 
 		 514 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.814968  normal  0.67864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2840  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  71.4 
 
 		 508 aa  722    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0918  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.71 
 
 		 508 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1861  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.92 
 
 		 509 aa  697    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.882391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1647  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.47 
 
 		 509 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0943  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.71 
 
 		 508 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0566  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.5 
 
 		 514 aa  646    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1677  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.85 
 
 		 510 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05733  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 518 aa  1040    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2585  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.08 
 
 		 509 aa  708    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2027  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.85 
 
 		 510 aa  773    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.788341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1579  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  75.48 
 
 		 509 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00582835  normal  0.12853 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000126  NAD(P) transhydrogenase alpha subunit  93.44 
 
 		 518 aa  935    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3065  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  72.2 
 
 		 508 aa  729    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000358371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2831  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.12 
 
 		 514 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0931  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  69.2 
 
 		 518 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.867027  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0623  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  83.78 
 
 		 518 aa  862    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0952  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.71 
 
 		 508 aa  722    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2401  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.08 
 
 		 509 aa  721    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2296  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.66 
 
 		 508 aa  713    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.630039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1695  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.47 
 
 		 509 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000435581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0232  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.06 
 
 		 510 aa  769    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.965834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3081  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.66 
 
 		 508 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0891  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.66 
 
 		 508 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1830  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.47 
 
 		 508 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3194  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.58 
 
 		 509 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2078  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  73.31 
 
 		 509 aa  697    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0854  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.85 
 
 		 508 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00327911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1810  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  74.95 
 
 		 510 aa  783    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.183733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0262  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60.8 
 
 		 522 aa  624  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2277  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.6 
 
 		 524 aa  594  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.317985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0091  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.95 
 
 		 507 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0101  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.95 
 
 		 507 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0110  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.95 
 
 		 507 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.196213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2119  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.89 
 
 		 520 aa  591  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000319763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2768  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.24 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0726  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  63.53 
 
 		 515 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0120  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  64.99 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.301316  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0547  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  61.39 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2492  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  57.84 
 
 		 523 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1883  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.77 
 
 		 523 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4667  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.02 
 
 		 518 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0240  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.58 
 
 		 523 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.986239  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2174  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  57.14 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0277505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1582  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.2 
 
 		 523 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.154994  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1814  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  60.35 
 
 		 518 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  59.3 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3900  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.79 
 
 		 525 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0260  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.48 
 
 		 494 aa  535  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1653  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.43 
 
 		 529 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.46455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3282  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.88 
 
 		 524 aa  525  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.34 
 
 		 517 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1233  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.57 
 
 		 538 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.111376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3754  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  56.66 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5778  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.58 
 
 		 543 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809454  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07820  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  52.76 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2246  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  51.32 
 
 		 523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5542  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  55.2 
 
 		 533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.6 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1076  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50.76 
 
 		 518 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0708  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  54.15 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1396  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  58.11 
 
 		 532 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.843319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7228  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.52 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  52.56 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24210  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  52.51 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2265  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  53.23 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.39241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2783  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.54 
 
 		 538 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158107 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  49.15 
 
 		 1060 aa  438  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10581  predicted protein  45.25 
 
 		 533 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25840  predicted protein  47.97 
 
 		 1128 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2547  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  50 
 
 		 376 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2183  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.84 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  47.88 
 
 		 373 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0956  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  45.41 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00245688  hitchhiker  0.000000175975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.83 
 
 		 373 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5070  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.83 
 
 		 373 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0853824  hitchhiker  0.00742692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0175  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.83 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4705  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.99 
 
 		 380 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.13 
 
 		 372 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0114  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.56 
 
 		 373 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2823  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.81 
 
 		 373 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2963  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  46.03 
 
 		 401 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3430  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  45.72 
 
 		 385 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2896  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.26 
 
 		 385 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3200  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.26 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0144615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>