More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3052 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  100 
 
 
481 aa  983    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  64.92 
 
 
487 aa  635    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  61.55 
 
 
489 aa  610  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  58.49 
 
 
490 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  55.35 
 
 
481 aa  554  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  43.82 
 
 
494 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  43.4 
 
 
494 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  43.01 
 
 
494 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  41.34 
 
 
494 aa  366  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  38.72 
 
 
538 aa  329  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1599  CoB-CoM heterodisulfide reductase, subunit D  29.73 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
433 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1774  hypothetical protein  31.78 
 
 
356 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.54 
 
 
411 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1652  hypothetical protein  32.29 
 
 
355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  25.71 
 
 
711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  25.75 
 
 
714 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0950  iron-sulfur binding reductase  30.66 
 
 
388 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.82 
 
 
414 aa  133  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  25.95 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  29.5 
 
 
421 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.99 
 
 
442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  28.83 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  25 
 
 
711 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  27.83 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  27.64 
 
 
416 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  25.54 
 
 
712 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
714 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 
722 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  25 
 
 
711 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  27.46 
 
 
375 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.29 
 
 
423 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.11 
 
 
414 aa  124  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  26.87 
 
 
423 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.5 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  27.66 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1994  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  35.32 
 
 
344 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.9 
 
 
434 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.24 
 
 
722 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  27.08 
 
 
445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  25.44 
 
 
433 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.14 
 
 
383 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.65 
 
 
383 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0980  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.1 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0176  succinate dehydrogenase subunit B  34.47 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0285  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  30.77 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.847816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  25.69 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0038  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  39.68 
 
 
234 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1798  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.5 
 
 
234 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2789  fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.91 
 
 
247 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0376  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.07 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  26.37 
 
 
441 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0305  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.71 
 
 
216 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.02 
 
 
661 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  25.93 
 
 
730 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0676  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  30.72 
 
 
319 aa  117  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0212132  hitchhiker  0.00094044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  29.11 
 
 
661 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  28.35 
 
 
428 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  29.23 
 
 
671 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.77 
 
 
453 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.61 
 
 
471 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  27.49 
 
 
661 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.5 
 
 
447 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0128  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  34.04 
 
 
345 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.579752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.65 
 
 
413 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2343  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.62 
 
 
344 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01874  succinate dehydrogenase catalytic subunit  32.62 
 
 
236 aa  116  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000253868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  27.32 
 
 
661 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  27.39 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.32 
 
 
661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1724  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  35.71 
 
 
258 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2231  fumarate reductase iron-sulfur subunit  34.09 
 
 
252 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  27.11 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  27.16 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.13 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.25 
 
 
447 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0249  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  31.49 
 
 
340 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.237523  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1798  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.48 
 
 
236 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0325296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.25 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0952  hypothetical protein  28.93 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.82 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.32 
 
 
426 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.96 
 
 
465 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2915  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  33.47 
 
 
238 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  28.19 
 
 
427 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2716  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.34 
 
 
344 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0418  fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.43 
 
 
244 aa  113  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000385701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  26.34 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2703  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  32.9 
 
 
234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00554103 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1071  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  26.34 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002236  succinate dehydrogenase iron-sulfur protein  33.64 
 
 
252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0309  succinate dehydrogenase subunit B  32.92 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.24045 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1029  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit B  31.69 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.77588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  26.34 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1278  fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.44 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00864476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.04 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0470  fumarate reductase iron-sulfur subunit  32.43 
 
 
244 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0101  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
236 aa  111  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2167  succinate dehydrogenase subunit B  33.33 
 
 
234 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  0.357247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>