33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1181 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1181  V-type ATP synthase subunit C  100 
 
 
351 aa  715    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000792947  normal  0.370579 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0285  V-type ATP synthase subunit C  58.4 
 
 
351 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2679  V-type ATP synthase subunit C  57.83 
 
 
351 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111965  normal  0.0612374 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2347  V-type ATP synthase subunit C  56.94 
 
 
347 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1220  V-type ATP synthase subunit C  55.68 
 
 
352 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00015341  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1247  V-type ATP synthase subunit C  38.74 
 
 
370 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0182416  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2767  V-type ATP synthase subunit C  38.19 
 
 
371 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0592  V-type ATP synthase subunit C  37.04 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1611  V-type ATP synthase subunit C  35.61 
 
 
349 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0388  V-type ATP synthase subunit C  35.41 
 
 
360 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.912541  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3351  ATP synthase A1, C subunit  32.11 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1241  V-type ATP synthase subunit C  34.49 
 
 
357 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1373  ATP synthase A1, C subunit  32.84 
 
 
356 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1435  V-type ATP synthase subunit C  31.39 
 
 
357 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1279  V-type ATP synthase subunit C  32.19 
 
 
358 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0279  V-type ATP synthase subunit C  31.52 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.6298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1761  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  28.49 
 
 
349 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0365  V-type ATP synthase subunit C  24.64 
 
 
390 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.607223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0296  V-type ATP synthase subunit C  25.5 
 
 
391 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.680107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0551  V-type ATP synthase subunit C  25.5 
 
 
391 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1617  V-type ATP synthase subunit C  25.5 
 
 
391 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.172626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1451  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  29.87 
 
 
325 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  0.462064 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0063  V-type ATP synthase subunit C  23.41 
 
 
383 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0959  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  26.67 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2049  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  24.7 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1611  V-type ATP synthase subunit C  23.51 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.819581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1892  V-type ATP synthase subunit C  23.21 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1264  H+transporting two-sector ATPase C (AC39) subunit  22.12 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2366  V-type ATP synthase subunit C  23.98 
 
 
334 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1772  H+-transporting two-sector ATPase, C (AC39) subunit  25.17 
 
 
397 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19450  H(+)-transporting two-sector ATPase  20.45 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1700  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.38 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2265  V-type ATP synthase subunit C  22.16 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>