70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3378 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3378  hypothetical protein  100 
 
 
783 aa  1580    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3110  hypothetical protein  30.24 
 
 
768 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
469 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  41.41 
 
 
411 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3374  hypothetical protein  39.19 
 
 
421 aa  160  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  40.08 
 
 
401 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  38.71 
 
 
391 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3114  hypothetical protein  33.87 
 
 
471 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.138557  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3102  hypothetical protein  40.33 
 
 
410 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057545  normal  0.238846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2068  hypothetical protein  39.48 
 
 
432 aa  125  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183001  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2962  hypothetical protein  37.44 
 
 
488 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0278678  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3381  hypothetical protein  28.22 
 
 
433 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0021  hypothetical protein  27.64 
 
 
390 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.317886  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  32.34 
 
 
307 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  32.34 
 
 
307 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  32.34 
 
 
307 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  32.96 
 
 
526 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  28.02 
 
 
528 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  31.05 
 
 
540 aa  73.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  29.58 
 
 
580 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  30.28 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  30.28 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  30.28 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  31.72 
 
 
898 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0407  hypothetical protein  30.03 
 
 
499 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0427492  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  29.44 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  28.63 
 
 
588 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  26.53 
 
 
655 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  27.57 
 
 
423 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4815  hypothetical protein  28.57 
 
 
517 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.036701  normal  0.942051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  27.4 
 
 
468 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  28.04 
 
 
431 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  30.94 
 
 
401 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0428  hypothetical protein  39 
 
 
341 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0973739  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0419  PE-PPE-like protein  39 
 
 
341 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4281  PE-PPE-like protein  25.86 
 
 
517 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4367  hypothetical protein  25.86 
 
 
517 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  27 
 
 
448 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  29.91 
 
 
494 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4660  hypothetical protein  25.95 
 
 
517 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.741942  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  27.88 
 
 
427 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0415  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0863013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0403  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121348  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0424  hypothetical protein  27.18 
 
 
284 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  32.26 
 
 
416 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  25.25 
 
 
377 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  25.25 
 
 
377 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  25.25 
 
 
377 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  27.23 
 
 
380 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  23.55 
 
 
413 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5179  hypothetical protein  28.45 
 
 
396 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1918  hypothetical protein  34.51 
 
 
533 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.777477  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  24.8 
 
 
518 aa  52  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3238  hypothetical protein  50 
 
 
464 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0675141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  24.75 
 
 
502 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4081  hypothetical protein  28.97 
 
 
461 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0716576  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  25.82 
 
 
409 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3227  hypothetical protein  48 
 
 
456 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3289  hypothetical protein  48 
 
 
456 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  29.89 
 
 
359 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  23.89 
 
 
435 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10153  PE family protein  26.06 
 
 
533 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  26.23 
 
 
527 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5082  hypothetical protein  47.83 
 
 
464 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4994  hypothetical protein  47.83 
 
 
464 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5375  hypothetical protein  47.83 
 
 
469 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231536  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  25.95 
 
 
433 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  25.95 
 
 
433 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  25.95 
 
 
413 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>