28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3289 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3227  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  899    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3238  hypothetical protein  93.75 
 
 
464 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0675141  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3289  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  899    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4267  hypothetical protein  39.38 
 
 
427 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4038  hypothetical protein  39.38 
 
 
427 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4113  hypothetical protein  39.38 
 
 
427 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486934  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3971  hypothetical protein  34.61 
 
 
421 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.050364  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0567  hypothetical protein  36.83 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.671954  normal  0.0144109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0555  hypothetical protein  36.83 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0545  hypothetical protein  36.83 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4536  hypothetical protein  35.61 
 
 
428 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.338835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5821  hypothetical protein  29.48 
 
 
453 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5909  hypothetical protein  26.91 
 
 
382 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0487598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1343  hypothetical protein  31.12 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0292  hypothetical protein  27.5 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00960981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0052  hypothetical protein  30.62 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3585  hypothetical protein  30.23 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5375  hypothetical protein  29.55 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231536  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3653  hypothetical protein  29.47 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3580  hypothetical protein  29.47 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4994  hypothetical protein  39.64 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5082  hypothetical protein  39.64 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11668  PE-PGRS family protein  34.07 
 
 
386 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.28721e-28  normal  0.49244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1753  hypothetical protein  29.8 
 
 
445 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3462  hypothetical protein  23.89 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3525  hypothetical protein  23.89 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0614946  normal  0.20364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3473  hypothetical protein  23.89 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0148464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2723  hypothetical protein  25.11 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78385  normal  0.212665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>