22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0052 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0052  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5909  hypothetical protein  34.88 
 
 
382 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0487598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1343  hypothetical protein  39.32 
 
 
347 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3238  hypothetical protein  32.17 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0675141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1938  hypothetical protein  35.18 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3227  hypothetical protein  31.78 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3289  hypothetical protein  31.78 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3971  hypothetical protein  27.57 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.050364  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2285  hypothetical protein  27.2 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4381  hypothetical protein  27.67 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1753  hypothetical protein  31.4 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0567  hypothetical protein  31.17 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.671954  normal  0.0144109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0545  hypothetical protein  31.17 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0555  hypothetical protein  31.17 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4113  hypothetical protein  27.6 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486934  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4038  hypothetical protein  27.6 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4267  hypothetical protein  27.6 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5375  hypothetical protein  26.58 
 
 
469 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231536  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5082  hypothetical protein  27.65 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4994  hypothetical protein  27.65 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  41.1 
 
 
1198 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3585  hypothetical protein  28.68 
 
 
460 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>