20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3462 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3462  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  931    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3473  hypothetical protein  98.74 
 
 
476 aa  920    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0148464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3525  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  931    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0614946  normal  0.20364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2723  hypothetical protein  36.61 
 
 
471 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78385  normal  0.212665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5821  hypothetical protein  34.63 
 
 
453 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0292  hypothetical protein  30.34 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00960981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4038  hypothetical protein  29.74 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4267  hypothetical protein  29.74 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4113  hypothetical protein  29.74 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3238  hypothetical protein  25.91 
 
 
464 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0675141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3227  hypothetical protein  25.61 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3289  hypothetical protein  25.61 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3971  hypothetical protein  26.5 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.050364  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0545  hypothetical protein  29.28 
 
 
434 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0567  hypothetical protein  29.28 
 
 
434 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.671954  normal  0.0144109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0555  hypothetical protein  29.28 
 
 
434 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1753  hypothetical protein  45.9 
 
 
445 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5082  hypothetical protein  35.8 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.310805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4994  hypothetical protein  35.8 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5375  hypothetical protein  35.8 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231536  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>