60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2914 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  68.28 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  68.28 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  68.28 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  62.67 
 
 
148 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  50.69 
 
 
141 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  44 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  42.86 
 
 
147 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  43.05 
 
 
150 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  45.77 
 
 
130 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  38.98 
 
 
156 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  48.06 
 
 
133 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  45.24 
 
 
133 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  43.65 
 
 
134 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  43.65 
 
 
133 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  43.38 
 
 
133 aa  94.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  43.17 
 
 
131 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  47.18 
 
 
130 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  41.26 
 
 
136 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  41.67 
 
 
134 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  37.25 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  41.04 
 
 
125 aa  89.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  43.57 
 
 
132 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  43.94 
 
 
130 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  44.8 
 
 
130 aa  87.8  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  42.03 
 
 
130 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  40.15 
 
 
135 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  42.65 
 
 
131 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40 
 
 
161 aa  85.5  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  42.11 
 
 
134 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  41.67 
 
 
136 aa  84.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  45 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  43.31 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  42.45 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  38.1 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  43.57 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  38.4 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  38.73 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  41.01 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  42.74 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  40.14 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  38.28 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  37.88 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  38.69 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  37.68 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  40.31 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  31.69 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  30.22 
 
 
138 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  30.5 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  33.58 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  32.31 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  32.85 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.04 
 
 
127 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  32.85 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  31.54 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  34.06 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  30.88 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  33.85 
 
 
133 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  40.48 
 
 
131 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  29.58 
 
 
142 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>