More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0434 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  100 
 
 
434 aa  847    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  66.74 
 
 
461 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2136  ammonium transporter  62.53 
 
 
480 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0199  ammonium transporter  59.68 
 
 
515 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.356507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0218  ammonium transporter  59.91 
 
 
524 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000738069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  57.01 
 
 
494 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0343  ammonium transporter  58.76 
 
 
436 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0303  ammonium transporter  64.93 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  57.74 
 
 
513 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0241  ammonium transporter  57.51 
 
 
510 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60924  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  64.06 
 
 
468 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  58.05 
 
 
436 aa  484  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0919  ammonium transporter  57.48 
 
 
428 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  57.79 
 
 
504 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0513  ammonium transporter  57.88 
 
 
428 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0566  ammonium transporter  57.88 
 
 
428 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.887749  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0523  ammonium transporter  57.88 
 
 
428 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  57.64 
 
 
428 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0507  ammonium transporter  57.88 
 
 
428 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  58.05 
 
 
466 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00403  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3158  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  58.05 
 
 
444 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00407  hypothetical protein  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  58.05 
 
 
478 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  58.29 
 
 
469 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0495  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  58.05 
 
 
466 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0540  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53448  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3164  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0378  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  474  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0528  ammonium transporter  57.39 
 
 
428 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  58.05 
 
 
466 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  58.05 
 
 
500 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  58.05 
 
 
500 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1110  ammonium transporter  56.22 
 
 
428 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0348758  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0487  ammonium transporter  57.14 
 
 
428 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3250  ammonium transporter  56.01 
 
 
430 aa  471  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1817  ammonium transporter  53.07 
 
 
500 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.664398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  57.32 
 
 
500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1061  ammonium transporter  55.53 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  57.56 
 
 
504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  57.32 
 
 
500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  57.32 
 
 
500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  55.84 
 
 
438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  55.84 
 
 
438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3077  ammonium transporter  58.79 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.822444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  56.94 
 
 
499 aa  465  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  56.83 
 
 
500 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0373  ammonium transporter  55.95 
 
 
480 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5498  ammonium transporter  52.85 
 
 
500 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0448  ammonium transporter  54.17 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.595017  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  55.14 
 
 
435 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  59.17 
 
 
452 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3038  ammonium transporter  58.79 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.447574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3219  ammonium transporter  58.79 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  57.67 
 
 
476 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3626  ammonium transporter  52.19 
 
 
499 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  57.91 
 
 
477 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0272  ammonium transporter  53.21 
 
 
480 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0184  ammonium transporter  57.56 
 
 
515 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.186841  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2375  ammonium transporter  52.53 
 
 
498 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.442944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2099  ammonium transporter  53.63 
 
 
498 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315626  normal  0.0101926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2051  ammonium transporter  52.97 
 
 
498 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.608567  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0121  ammonium transporter  58.01 
 
 
521 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0596893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  57.07 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3236  ammonium transporter  59.51 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3051  ammonium transporter  59.41 
 
 
451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2546  ammonium transporter  60.14 
 
 
450 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  55.48 
 
 
445 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0888  ammonium transporter  60.14 
 
 
450 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  55.74 
 
 
444 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1860  ammonium transporter  50.97 
 
 
506 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.889912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  55.85 
 
 
501 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  57.56 
 
 
502 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0278  ammonium transporter  53.74 
 
 
480 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03566  ammonium transporter  59.17 
 
 
480 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0120  ammonium transporter  59.06 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  55.64 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0111  ammonium transporter  60.84 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0168687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0593  ammonium transporter  60.44 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0473  ammonium transporter  56.43 
 
 
522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  56.83 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  51.65 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  56.83 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0164  ammonium transporter  61.58 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.611454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0172  putative ammonium transporter transmembrane protein  57.11 
 
 
508 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17564  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0182  ammonium transporter  61.58 
 
 
473 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0599171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2864  ammonium transporter  54.71 
 
 
430 aa  443  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.962346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3056  ammonium transporter  54.02 
 
 
430 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2277  ammonium transporter  53 
 
 
441 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459413  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  52.98 
 
 
433 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  53.24 
 
 
433 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  57.67 
 
 
444 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1122  ammonium transporter  56.41 
 
 
483 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.909008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1088  ammonium transporter  56.9 
 
 
484 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.149046  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0218  ammonium transporter  56.38 
 
 
445 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0219  ammonium transporter  58.2 
 
 
432 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  56.74 
 
 
442 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3313  ammonium transporter  57.11 
 
 
512 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  0.097706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>