31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1392 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  100 
 
 
390 aa  803    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  52.1 
 
 
414 aa  421  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  47.87 
 
 
395 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  42.86 
 
 
387 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  39.29 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  40.35 
 
 
387 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  38.29 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  37.88 
 
 
386 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  40.71 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  40.25 
 
 
374 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  37.44 
 
 
392 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  39.15 
 
 
380 aa  259  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  38.42 
 
 
404 aa  259  8e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  35.75 
 
 
388 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  34.13 
 
 
389 aa  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  28.39 
 
 
348 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  28.06 
 
 
373 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  29.55 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  37.91 
 
 
312 aa  120  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  38.25 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  37.36 
 
 
312 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  32.64 
 
 
330 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  28.74 
 
 
363 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  28.05 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  28.05 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  26.4 
 
 
355 aa  86.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  29.26 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  23.8 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  23.08 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  22.36 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  22.36 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>