More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1376 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
479 aa  982    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
476 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
476 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
476 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
475 aa  525  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
468 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
481 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
466 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
485 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
466 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
468 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
500 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
466 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
474 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
493 aa  416  9.999999999999999e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
490 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
476 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
477 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
486 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
474 aa  415  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
485 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
458 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
478 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
457 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
465 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
480 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
459 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
478 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
466 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
469 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
470 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
459 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
460 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
465 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
460 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
494 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
479 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
470 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
493 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
460 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
459 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
469 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
472 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
461 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
466 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
459 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
455 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
461 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
459 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
457 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
472 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
459 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
461 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
462 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
484 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
465 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
466 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
461 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
486 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
485 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
460 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
461 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
465 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
461 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
459 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
485 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
465 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
481 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
461 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
461 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
485 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
459 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
460 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
484 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
461 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 
461 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
485 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
470 aa  382  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
460 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
459 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
459 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
459 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>