More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02122 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  70.26 
 
 		 875 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  70.26 
 
 		 875 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2058  DNA gyrase, A subunit  73.08 
 
 		 916 aa  772    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000369381  unclonable  0.00000000000693229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1731  DNA gyrase subunit A  71.91 
 
 		 901 aa  735    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0884555  hitchhiker  0.00443229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003111  DNA gyrase subunit A  68.56 
 
 		 906 aa  719    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00046231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2846  DNA gyrase subunit A  72.62 
 
 		 897 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2498  DNA gyrase subunit A  73.44 
 
 		 878 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2606  DNA gyrase subunit A  70.26 
 
 		 875 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  75 
 
 		 908 aa  780    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  69.14 
 
 		 919 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2303  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  73.05 
 
 		 904 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3269  DNA gyrase subunit A  70 
 
 		 882 aa  743    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00267185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2404  DNA gyrase, A subunit  72.88 
 
 		 916 aa  770    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00637691  unclonable  0.0000191603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2457  DNA gyrase subunit A  73.24 
 
 		 878 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0910619  normal  0.208896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2379  DNA gyrase subunit A  70.26 
 
 		 875 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.076856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2767  DNA gyrase subunit A  72.62 
 
 		 897 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0123016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1039  DNA gyrase subunit A  70.36 
 
 		 878 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1420  DNA gyrase subunit A  70.06 
 
 		 875 aa  710    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1310  DNA gyrase subunit A  72.62 
 
 		 885 aa  736    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0388177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2067  DNA gyrase, A subunit  72.8 
 
 		 903 aa  769    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0392339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02116  hypothetical protein  70.26 
 
 		 875 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2526  DNA gyrase subunit A  70.26 
 
 		 875 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3365  DNA gyrase subunit A  70.46 
 
 		 875 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.329132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1949  DNA gyrase, A subunit  70.36 
 
 		 879 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0708311  hitchhiker  0.00786865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2799  DNA gyrase subunit A  72.46 
 
 		 888 aa  745    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107498  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2062  DNA gyrase, A subunit  73.08 
 
 		 916 aa  772    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000488148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2371  DNA gyrase subunit A  70.66 
 
 		 875 aa  715    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2408  DNA gyrase subunit A  73.24 
 
 		 878 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000367831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  71.46 
 
 		 908 aa  782    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2512  DNA gyrase subunit A  73.24 
 
 		 878 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0982635 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  62.67 
 
 		 847 aa  642    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2287  DNA gyrase, A subunit  73.08 
 
 		 916 aa  772    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000928458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1114  DNA gyrase, A subunit  71.51 
 
 		 898 aa  738    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  88.8 
 
 		 897 aa  899    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2306  DNA gyrase, A subunit  71.99 
 
 		 905 aa  785    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0379216  hitchhiker  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02730  DNA gyrase subunit A  70.2 
 
 		 878 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1105  DNA gyrase subunit A  73.08 
 
 		 879 aa  754    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0580579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1767  DNA gyrase subunit A  71.34 
 
 		 885 aa  719    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  63.72 
 
 		 881 aa  673    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  69.9 
 
 		 946 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  69.71 
 
 		 944 aa  727    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2130  DNA gyrase, A subunit  71.86 
 
 		 909 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.717755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3211  DNA gyrase subunit A  73.28 
 
 		 879 aa  757    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02122  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 		 545 aa  1096    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00138777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2616  DNA gyrase subunit A  73.24 
 
 		 878 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.341614 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0877  DNA gyrase, subunit A  71.26 
 
 		 894 aa  719    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000517937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3019  DNA gyrase subunit A  68.88 
 
 		 877 aa  730    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.542004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1972  DNA gyrase subunit A  69.52 
 
 		 918 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000455042  hitchhiker  0.000000817353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2070  DNA gyrase, A subunit  74.55 
 
 		 917 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000122106  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  59.24 
 
 		 863 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  60.39 
 
 		 863 aa  611  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1021  DNA gyrase, A subunit  59.2 
 
 		 856 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0962038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0571  DNA gyrase, A subunit  59.33 
 
 		 856 aa  594  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.533459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2148  DNA gyrase subunit A  54.33 
 
 		 886 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0598325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  58.72 
 
 		 864 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  57.88 
 
 		 887 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  59.4 
 
 		 862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2860  DNA gyrase, A subunit  56.5 
 
 		 896 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120458  decreased coverage  0.000000000549862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  59.6 
 
 		 860 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1374  DNA gyrase subunit A  52.58 
 
 		 923 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  53.83 
 
 		 907 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  53.85 
 
 		 922 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  53.86 
 
 		 921 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1961  DNA gyrase subunit A  53.68 
 
 		 921 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.844346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  51.56 
 
 		 923 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  53.12 
 
 		 910 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  51.9 
 
 		 919 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  53.2 
 
 		 921 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3041  DNA gyrase subunit A  55.36 
 
 		 883 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.894078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  52.81 
 
 		 928 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  53.7 
 
 		 925 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1539  DNA gyrase subunit A  55.14 
 
 		 850 aa  551  1e-155  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.202951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  53.28 
 
 		 871 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  54.78 
 
 		 893 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0638  DNA gyrase, A subunit  54.94 
 
 		 848 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00668409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  53.06 
 
 		 879 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  54.69 
 
 		 846 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1339  DNA gyrase, A subunit  53.99 
 
 		 864 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0126105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  53.97 
 
 		 849 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  53.21 
 
 		 859 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1204  DNA gyrase, A subunit  56.06 
 
 		 870 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41811  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  53.09 
 
 		 885 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0842  DNA gyrase subunit A  53.47 
 
 		 889 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18082  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0771  DNA gyrase subunit A  53.28 
 
 		 889 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.380841  hitchhiker  0.00768544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  52.69 
 
 		 883 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 867 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  53.66 
 
 		 864 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  53.24 
 
 		 897 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 867 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2264  DNA gyrase subunit A  53.31 
 
 		 867 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 867 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0920  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 867 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0820357 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0953  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 866 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.665662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 866 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  53.24 
 
 		 866 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0999  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 851 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0195  DNA gyrase subunit A  53.05 
 
 		 866 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2888  DNA gyrase subunit A  53.24 
 
 		 866 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2951  DNA gyrase subunit A  53.24 
 
 		 866 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  52.85 
 
 		 867 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>