More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1714 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.51 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.51 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.09 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.68 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  58.09 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.62 
 
 		 243 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  54.2 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.25 
 
 		 240 aa  254  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.25 
 
 		 240 aa  254  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  51.67 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  53.25 
 
 		 772 aa  241  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  45.38 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  54.17 
 
 		 797 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.63 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  50.42 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1094  precorrin-3 methyltransferase  55.42 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  48.35 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  52.03 
 
 		 776 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  47.76 
 
 		 777 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.79 
 
 		 867 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.59 
 
 		 520 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.89 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  47.11 
 
 		 329 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  47.11 
 
 		 329 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  49.17 
 
 		 240 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  45.68 
 
 		 458 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  45.45 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  50 
 
 		 596 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  48.95 
 
 		 655 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  46.69 
 
 		 423 aa  226  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.44 
 
 		 284 aa  221  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.75 
 
 		 472 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  44.4 
 
 		 537 aa  218  7e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  46.28 
 
 		 326 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.12 
 
 		 328 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  53.56 
 
 		 787 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  46 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16381  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C18-methyltransferace  46.06 
 
 		 620 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.25 
 
 		 327 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.08 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  43.67 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.87 
 
 		 331 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.13 
 
 		 451 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  44.73 
 
 		 468 aa  209  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.97 
 
 		 481 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.26 
 
 		 623 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.26 
 
 		 623 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.04 
 
 		 629 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  45.75 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  42.32 
 
 		 594 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.04 
 
 		 266 aa  204  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0471  precorrin-3B methylase  44.96 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.12 
 
 		 469 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.03 
 
 		 631 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  45.42 
 
 		 561 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  41.32 
 
 		 663 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0329  precorrin-3 methyltransferase  41.74 
 
 		 579 aa  201  6e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.189951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.91 
 
 		 435 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3648  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.25 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1896  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.63 
 
 		 572 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.392663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.33 
 
 		 810 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0936  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.96 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17041  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  40.66 
 
 		 604 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1081  precorrin-3 methyltransferase  38.93 
 
 		 593 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.49 
 
 		 837 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19561  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  37.86 
 
 		 593 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.62 
 
 		 800 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  41.13 
 
 		 574 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.68 
 
 		 565 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.26 
 
 		 560 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.95 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.8 
 
 		 778 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.53 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.26 
 
 		 560 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.93 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2014  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000268316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.49 
 
 		 595 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.08 
 
 		 577 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  46.28 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.15 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.29 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0236  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.34 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.717324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.27 
 
 		 563 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.57 
 
 		 612 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  37.25 
 
 		 567 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17171  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  39.42 
 
 		 600 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.96 
 
 		 567 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17291  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  41.08 
 
 		 600 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.792145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.34 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.91 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1854  precorrin-3 methyltransferase  41.63 
 
 		 566 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0991  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.94 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26530  precorrin-3 methylase CobJ  41.7 
 
 		 559 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0702387  normal  0.593187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3119  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.54 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.53 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.08 
 
 		 571 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0485556 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  39.27 
 
 		 581 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>