More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1750 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.51 
 
 
809 aa  941    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  931    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.78 
 
 
809 aa  969    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.51 
 
 
809 aa  942    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  67.56 
 
 
815 aa  1101    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  931    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  69.18 
 
 
814 aa  1151    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.25 
 
 
794 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
816 aa  1644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.64 
 
 
815 aa  969    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  46.56 
 
 
781 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.63 
 
 
809 aa  930    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  931    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.17 
 
 
810 aa  928    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.5 
 
 
792 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  937    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.61 
 
 
818 aa  820    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2854  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  66.79 
 
 
812 aa  1090    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.440462  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1341  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.75 
 
 
810 aa  1138    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.63 
 
 
809 aa  929    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.2 
 
 
784 aa  736    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2107  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.47 
 
 
808 aa  1134    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123782  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.59 
 
 
811 aa  947    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.34 
 
 
811 aa  949    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.44 
 
 
815 aa  966    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.17 
 
 
810 aa  937    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.51 
 
 
809 aa  941    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2849  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  67.98 
 
 
808 aa  1130    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0102687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1642  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.78 
 
 
809 aa  976    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3020  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.34 
 
 
796 aa  748    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.7 
 
 
797 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.76 
 
 
809 aa  934    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.41 
 
 
810 aa  931    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0834  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.83 
 
 
818 aa  839    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.51 
 
 
809 aa  941    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.83 
 
 
809 aa  977    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  67.44 
 
 
813 aa  1114    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  64.33 
 
 
821 aa  1046    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  69.06 
 
 
814 aa  1150    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1883  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  70.06 
 
 
806 aa  1154    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0428661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.21 
 
 
792 aa  631  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.9 
 
 
816 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.54 
 
 
791 aa  619  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.73 
 
 
792 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.34 
 
 
792 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.48 
 
 
792 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43 
 
 
792 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01682  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  41.83 
 
 
795 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0961927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1929  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.83 
 
 
795 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.64 
 
 
789 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2431  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.83 
 
 
795 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175376  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1918  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.83 
 
 
795 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333448  normal  0.421493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.83 
 
 
795 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1793  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.83 
 
 
795 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000955232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01671  hypothetical protein  41.83 
 
 
795 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0686641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.41 
 
 
793 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24212  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.28 
 
 
793 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1955  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.83 
 
 
795 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.111711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.46 
 
 
793 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.025038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.16 
 
 
793 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.7 
 
 
795 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.71 
 
 
795 aa  598  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.7 
 
 
795 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2185  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.34 
 
 
795 aa  595  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.861692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.46 
 
 
795 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.46 
 
 
795 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1145  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.93 
 
 
793 aa  595  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.88 
 
 
794 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.12 
 
 
795 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
795 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
795 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.85 
 
 
793 aa  589  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1835  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
795 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000347523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1466  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
795 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1433  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.1 
 
 
795 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.030197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.93 
 
 
807 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0870176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1956  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.73 
 
 
795 aa  588  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2149  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.71 
 
 
795 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625217  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  39.32 
 
 
801 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.66 
 
 
792 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.07 
 
 
795 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1603  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.95 
 
 
795 aa  579  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.643795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.71 
 
 
795 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.8 
 
 
792 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1732  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.15 
 
 
795 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00878056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.78 
 
 
790 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.29 
 
 
795 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.41 
 
 
792 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.93 
 
 
795 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.45 
 
 
806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
795 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
795 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.54 
 
 
795 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.95 
 
 
795 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.37 
 
 
795 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.29 
 
 
795 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.93 
 
 
795 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  38.29 
 
 
795 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>