62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0224 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  60.16 
 
 		 1125 aa  1308    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  56.18 
 
 		 1144 aa  1238    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 1133 aa  2274    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  56.36 
 
 		 1143 aa  1234    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  65.24 
 
 		 1124 aa  1416    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  64.54 
 
 		 1121 aa  1436    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  45.58 
 
 		 1123 aa  826    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  63.67 
 
 		 1122 aa  1437    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  64.96 
 
 		 1121 aa  1441    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  65.16 
 
 		 1121 aa  1472    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  65.25 
 
 		 1140 aa  1409    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  64.96 
 
 		 1125 aa  1462    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  61.72 
 
 		 1121 aa  1385    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  65.63 
 
 		 1121 aa  1442    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  47.13 
 
 		 1130 aa  935    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  47.18 
 
 		 1166 aa  953    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  30.27 
 
 		 1133 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  32.98 
 
 		 1143 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  31.96 
 
 		 1124 aa  433  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1126 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1137 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1128 aa  314  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.72 
 
 		 1136 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  54.33 
 
 		 352 aa  259  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1120 aa  250  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1118 aa  222  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.47 
 
 		 1153 aa  213  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.39 
 
 		 1154 aa  212  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  25.98 
 
 		 979 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1045 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1146 aa  191  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1121 aa  187  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1126 aa  160  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1120 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1120 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1118 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1114 aa  151  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1120 aa  140  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1125 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1151 aa  132  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.04 
 
 		 694 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1181 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  26.6 
 
 		 462 aa  104  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  24.51 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  25.37 
 
 		 1093 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  24.78 
 
 		 1107 aa  68.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  26.61 
 
 		 1207 aa  68.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  27.97 
 
 		 1228 aa  65.1  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  23.64 
 
 		 1159 aa  61.6  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  32.73 
 
 		 1113 aa  59.7  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  69.44 
 
 		 54 aa  58.5  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  27.24 
 
 		 1159 aa  57  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1159 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1159 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1138 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1214 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  28.22 
 
 		 1109 aa  48.5  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1140 aa  47.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  34.55 
 
 		 604 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  58.82 
 
 		 109 aa  46.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>